Homológ fehérje-csoportok felkutatása szekvenált gomba fajok körében bioinformatikai eszközökkel

Debreceni Egyetem

Juhász-Nagy Pál Doktori Iskola

Pócsi István

biológiai tudományok

A világban napjainkig körülbelül ezer fajnak határozták meg a genom szekvenciáját. Ez a szám évente nagyjából megduplázódik. Azonban ezen fajok közül csak kevésnek van meg a kísérleti bizonyítékokon alapuló, viszonylag részletes, gének szerinti funkcionális leírása. Alapvető fontosságú az elméletileg hasonló működésű, homológ szerkezetű fehérjék megtalálása olyan fajokban is, ahol nem állnak rendelkezésre kísérleti eredmények a gének funkcióinak meghatározására.
Fontosabb célok:
- A témában, a világban használatos bioinformatikai módszerek és algoritmusok elemzése.
- Az eddig szekvenált gombafajok közül több tucat faj paralóg/ortológ proteinjeinek felkutatása és adatbázisba rendezése.
- Néhány általános protein-funkció elemzése a bioinformatikai módszerekkel kapott paralóg/ortológ fehérje-csoportokban.

1 fő

2009-05-15