Szilázs metagenom vizsgálatok

Debreceni Egyetem

Élelmiszertudományok Doktori Iskola

Pócsi István

élelmiszertudományok

A mikotoxin szennyeződés az élelmiszerekben és takarmányozásban globális kihívás. A legfontosabb szennyezést kiváltó gombák hazánkban az Aspergillus és Fusarium fonalasgomba nemzetségekbe tartoznak, toxinjaikkal szennyezhetnek a szántóföldön, takarmány-előkészítés, terménytárolás és -szállítás közben, emellett részben növényi patogén tulajdonságaik révén komoly terméskiesést is okozhatnak. A mikotoxin probléma gazdasági, továbbá humán- és állategészségügyi hatásai így megkövetelik a hatékony védekezés, megelőzés stratégiáinak kidolgozását, a gombák növénypatogenitásának megértését, valamint a mikotoxin-szennyezések eltávolítására irányuló módszerek fejlesztését. Ezen célok elérésére Tanszékünk komplex gombagenetikai- és genomikai, mikrobiológiai, metagenomikai és analitikai megközelítést alkalmaz. A tervezett doktori téma ezt a megközelítést használná fel ill. optimalizálná tovább. A doktorandusz feladata a Tanszék biológiai kontrollra alkalmas mikrobagyűjteményének bővítése elsősorban élesztőkkel, a mikotoxinokat termelő fonalasgombák elleni hatásuk tesztelése in vitro és szilázs fermentációs körülmények között, a fermentált szilázsban a mikrobiális közösség változásainak nyomon követése metagenomikai módszerekkel, a toxintermelés és a gombanövekedés gátlásának meghatározása, valamint genetikai és genomikai módszerekkel annak megállapítása, hogy mely élesztők milyen tulajdonságaik révén lépnek a fonalasgombákkal interakcióba. Mindezen kísérletekkel a célunk egy hatékony, gyakorlatban alkalmazható és megfelelő kísérleti adatokkal és bioinformatikai elemzésekkel alátámasztott megbízhatóságú biokontroll ill. toxingátló mikrobatörzs vagy törzskeverék kifejlesztése.

1 fő

Debreceni Egyetem

2021-05-17