Témakiírások
A pékélesztő hem oxigenáza élettani szerepének a felderítése
témakiírás címe
A pékélesztő hem oxigenáza élettani szerepének a felderítése
intézmény
doktori iskola
témakiíró
tudományág
témakiírás leírása
Az opportunista patogén gombafajok vasanyagcseréjének és hemolitikus tulajdonságainak megismerése, valamint az opportunista és kommenzalista gombák közötti különbségek felderítése hasznos ismeretekkel szolgálhat a mikózisok patogenezisének jobb megértéséhez. A hemolízis és a gombák vasanyagcseréje kapcsolatának megértése új terápiás eljárások lehetőségét is megteremtheti.
Számos, elsősorban fonalas ill. dimorf gomba, valamint egyes élesztők képesek opportunista patogénként viselkedni, ezen fajok közt α- és β-hemolizálók is akadnak. Az élesztők hemolitikus aktivitásának szerepe a patogenezisben még kevéssé kutatott ill. ismert terület, de feltételezhető, hogy a szisztémás fertőzéseknél komoly szerepe lehet a hemolitikus képességnek. A Saccharomyces genuszba tartozó élesztőket (pékélesztők, borélesztők, stb.) általánosan biztonságos mikrobáknak tekintjük, melyek azonban esetenként képesek opportunista patogénként viselkedni. Hasonlóan a Candida albicans-hoz, a Saccharoymces-ek is rendelkeznek hem oxigenáz enzimmel, melynek szerepe, különösen a patogenezis tekintetében, alulkutatott (Kim et al. 2006).
Jelen projekt keretében a hemolizáló képesség, illetve a HMX-1-hez szintén köthető oxidatív stressz tűrés (OSR) patogenezisben betöltött szerepét a következő vizsgálatok segítségével derítheti fel a jelölt. (1) Opportunista patogén, kommenzalista, valamint ipari Saccharomyces cerevisiae-izolátumok hemolitikus aktivitásának, valamint a HMX-1 hem oxigenáz gén kópiaszámának és a gén expressziójának összehasonlítása humán gazdaszervezetet jellemző és fermentációs/vad körülményeket jellemző körülmények esetén, kiegészítve az OSR vizsgálatával. (2) A hemolizáló képesség és OSR mikroevolúciós szintű változásainak nyomon követése klinikai izolátumok, illetve ezekből derivált utódtörzsek összehasonlításával, az eredmények párhuzamba állítása további virulenciafaktorokkal (pl. extracelluláris hidrolázok): a HMX-1 mikroevolúciós szerepének becslése. (3) Klinikai esettanulmányok áttekintésével a hemolízisre utaló kórképek elemzése opportunista élesztőinfekciók esetén (Saccharomyces ill. rokon fajok), a hemolizáló képesség patogenezisben való kimutatásának céljából. (4) A HMX-1 gén ortológjainak keresése bioinformatikai módszerekkel további Saccharomyces-fajok ill. rokon genuszok tagjaiban, ezen élesztők hemolitikus aktivitásának és virulenciájának összehasonlítása: a HMX-1 evolúciós szerepének becslése.
Kim et al. Biochemistry 2006; 45(49):14772-80
Számos, elsősorban fonalas ill. dimorf gomba, valamint egyes élesztők képesek opportunista patogénként viselkedni, ezen fajok közt α- és β-hemolizálók is akadnak. Az élesztők hemolitikus aktivitásának szerepe a patogenezisben még kevéssé kutatott ill. ismert terület, de feltételezhető, hogy a szisztémás fertőzéseknél komoly szerepe lehet a hemolitikus képességnek. A Saccharomyces genuszba tartozó élesztőket (pékélesztők, borélesztők, stb.) általánosan biztonságos mikrobáknak tekintjük, melyek azonban esetenként képesek opportunista patogénként viselkedni. Hasonlóan a Candida albicans-hoz, a Saccharoymces-ek is rendelkeznek hem oxigenáz enzimmel, melynek szerepe, különösen a patogenezis tekintetében, alulkutatott (Kim et al. 2006).
Jelen projekt keretében a hemolizáló képesség, illetve a HMX-1-hez szintén köthető oxidatív stressz tűrés (OSR) patogenezisben betöltött szerepét a következő vizsgálatok segítségével derítheti fel a jelölt. (1) Opportunista patogén, kommenzalista, valamint ipari Saccharomyces cerevisiae-izolátumok hemolitikus aktivitásának, valamint a HMX-1 hem oxigenáz gén kópiaszámának és a gén expressziójának összehasonlítása humán gazdaszervezetet jellemző és fermentációs/vad körülményeket jellemző körülmények esetén, kiegészítve az OSR vizsgálatával. (2) A hemolizáló képesség és OSR mikroevolúciós szintű változásainak nyomon követése klinikai izolátumok, illetve ezekből derivált utódtörzsek összehasonlításával, az eredmények párhuzamba állítása további virulenciafaktorokkal (pl. extracelluláris hidrolázok): a HMX-1 mikroevolúciós szerepének becslése. (3) Klinikai esettanulmányok áttekintésével a hemolízisre utaló kórképek elemzése opportunista élesztőinfekciók esetén (Saccharomyces ill. rokon fajok), a hemolizáló képesség patogenezisben való kimutatásának céljából. (4) A HMX-1 gén ortológjainak keresése bioinformatikai módszerekkel további Saccharomyces-fajok ill. rokon genuszok tagjaiban, ezen élesztők hemolitikus aktivitásának és virulenciájának összehasonlítása: a HMX-1 evolúciós szerepének becslése.
Kim et al. Biochemistry 2006; 45(49):14772-80
felvehető hallgatók száma
1 fő
helyszín
Debreceni Egyetem, Biotechnológiai és Mikrobiológiai Tanszék
jelentkezési határidő
2017-05-15