Thesis supervisor: Elfrieda Fodor
Location of studies (in Hungarian): MTA SZBK Biokémiai Intézet Abbreviation of location of studies: SZBK
Description of the research topic:
A fertőző szivacsos agysorvadás betegségei (TSE vagy prion betegségek) úgy nevezett konformációs betegségek melyek kialakulásért a natív prion fehérje harmadlagos szerkezetének (konformációjának) megváltozása és a konformációváltozás sejten/szerven belüli terjedése a felelős. A prion fehérje legfőképpen az agyban van jelen, a sejteken belül pedig a plazma membrán külső féltekébe ágyazódik egy glikozil-foszfatidilinozitol lipid horgony által. A prion betegségek jelenleg nem gyógyíthatóak. Ennek egyik oka az, hogy a sejtekben jelen lévő natív, helyes konformációjú prion fehérje pontos szerepe nem ismert eléggé.
Célunk, hogy a prion fehérje valamint a prion fehérjecsalád nemrég felfedezett további tagjainak funkcióját és egymáshoz való viszonyát vizsgáljuk in vivo emlős sejtkultúrákban, a fehérje kölcsönható partnereinek azonosításán keresztül. Ehhez részben egy módszer fejlesztésén dolgozunk, ami lehetővé kívánja tenni, hogy tetszés szerint módosított rekombináns fehérjéket juttassunk be sejtek plazmamembránjába, majd ezeket kovalensen kereszt kössük a kölcsönható partnerekkel. A keresztkötést a fehérje szekvenciájába genetikai úton célzott pozíciókba beépített erre alkalmas, módosított aminosavak segítségével hozzuk létre, így a fehérje kötőhelye is feltérképezhető. A megkötött fehérjepartnereket tisztítás után azonosítani kívánjuk. Párhuzamosan, más megközelítést is alkalmazunk a kölcsönható partnereinek keresésére, ami jelpeptid-fehérje fúziós DNS konstrukciók sejtbe juttatásán alapszik majd az expresszált fehérjék kötőpartnereikkel alkotott komplexeinek tisztításán és beazonosításán.
A fenti vizsgálatokhoz főként biokémiai, molekuláris biológiai, E. coli rendszerben történő rekombináns fehérje előállítás, sejtbiológiai módszereket valamint, mikroszkópos (fluoreszcens és konfokális) technikákat alkalmazunk.
Required language skills: angol Number of students who can be accepted: 1
Deadline for application: 2016-04-19
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Login
