témavezető: Csermely Péter
helyszín (magyar oldal): Semmelweis Egyetem, Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Pathobiokémiai Intézet, LINK-Csoport, www.linkgroup.hu helyszín rövidítés: SE
A kutatási téma leírása:
A multi-diszciplináris, igen széleskörű hálózatos együttműködést kialakító kutatócsoport 2004-ben alakult, jelenlegi tagjai a világ számos élvonalbeli kutatóhelyén (Cambridge, NIH, Northwestern, Oxford, Sanghai, Vanderbilt) is dolgoznak. Jelenleg végzett és tervezett kutatásaink azt célozzák, hogy megértsük a sejtben lévő fehérje-fehérje kölcsönhatási hálózatok, jelátviteli hálózatok, valamint a fehérjék szerkezetét leíró hálózatok
• csoportképzését, ennek hierarchikus viszonyait és változásait;
• nódusainak és csoportjainak a szerepét a perturbációk terjesztésében és a hálózat együttműködésében; valamint
• merevségi és plaszticitási viszonyainak leírását és ennek változásait.
A hálózatok fenti sajátosságait az egészséges és a beteg állapotok összehasonlítására, valamint az öregedés, az adaptáció (tanulás, emlékezés) és az evolúció vizsgálatára is fel kívánjuk használni.
A fenti célok elérésének érdekében az alábbi területek vizsgálatát tervezzük:
• hálózatok modulszerkezetének vizsgálata
• hálózatok peturbációs viszonyainak vizsgálata
• hálózatos kooperáció játékelméleti vizsgálata
• hálózatok merevségének és plaszticitásának vizsgálata
• kritikus átmenetek és ezeket befolyásoló nódusok vizsgálata
• a fenti témák alkalmazásai a gyógyszer-target keresésben.
A fenti témákkal kapcsolatos, saját fejlesztésű, szabadon letölthető programok itt érhetőek el: http://www.linkgroup.hu.
A kutatásokban a multi-diszciplináris kutatócsoport igen sokszor alkalmaz ökoszisztémákkal, valamint szociális, illetve mérnöki hálózatokkal (Internet, áramhálózat, stb.) kapcsolatos példákat is a hálózatok általánosítható viselkedésmódjainak megértésére. A konkrét kutatási téma a jelentkezővel való egyeztetés során alakul ki. Bővebbet a http://www.linkgroup.hu honlapon lehet találni a témák leírásáról. A témavezetőt a csermelynet@gmail.com email címen lehet elérni.
előírt nyelvtudás: angol további elvárások: Informatikai ismeretek előnyt jelentenek, de csak felhasználói szinten szükségesek pl. a http://www.linkgroup.hu honlapon elérhető programok kezeléséhez.