Login
 Forum
 
 
Thesis topic proposal
 
György Szittya
A paradicsom SlIDM1hiszton-acetiltranszferáz gén vizsgálata

THESIS TOPIC PROPOSAL

Institute: Hungarian University of Agriculture and Life Sciences, Gödöllő
biology
Doctoral School of Biological Sciences

Thesis supervisor: György Szittya
Location of studies (in Hungarian): MATE
Abbreviation of location of studies: MATE


Description of the research topic:

Az epigenetikai módosításoknak (pl. hiszton kód, DNS-metiláció) fontos szerepe van a növényfejlődés szabályozásában azáltal, hogy meghatározzák és fenntartják a sejttípus-specifikus génexpressziós mintázatot. A hiszton módosítások közül az acetilálás/deacetilálás fontos szereppel bír a transzkripció szabályozásában. A doktori képzés alatt a PhD hallgató azt fogja vizsgálni, hogy az epigenetikai változásoknak milyen szerepe van a paradicsom levél és a levélszőr fejlődésére. Korábban SlIDM1 hiszton-acetiltranszferáz mutáns paradicsomvonalakat állítottunk elő és megfigyeltük, hogy ezek a növények levele magasabb ambiens hőmérsékleten a vad típustól eltérően fejlődik, illetve ezek a növények több fedőszőrrel és mirigyszőrrel rendelkeznek mind a szárukon, mind a levelükön, mint vad típusú társaik. Az SlIDM1 gén az Arabidopsis AtIDM1 gén paradicsom ortológja. Az AtIDM1 a „mester regulátora” az Arabidopsis AtROS1 által közvetített genom szintű DNS citozin demetilációnak. Mivel a paradicsom SlIDM1 az Arabidopsis AtIDM1 ortológja, és a hiszton acetiláció általában a génaktivációhoz kapcsolódik, előzetes eredményeink alapján feltételezzük, hogy az SlIDM1 szabályozza a levél és levélszőr fejlődésért felelős gének expresszióját azáltal, hogy megakadályozza azok hipermetilációját. A doktori munka során az SlIDM1 által szabályozott, levél és levélszőr fejlődésért felelős géneket szeretnénk genomszinten azonosítani. Tervezzük továbbá az SlIDM1 fehérje időbeli és térbeli expressziós mintázatának vizsgálatát a növény fejlődése során.



Felvehető hallgatók száma: 1 fő



Kutatás helyszíne: MATE-GBI Növénybiotechnológia tanszék, 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4.



Előírt nyelvtudás: angol középfokú nyelvvizsga



Ajánlott nyelvtudás: angol középfokú nyelvvizsga



További szakmai elvárás: 1 év molekuláris biológiai gyakorlat

Required language skills: English
Number of students who can be accepted: 1

Deadline for application: 2024-05-31


2024. IV. 17.
ODT ülés
Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).

 
All rights reserved © 2007, Hungarian Doctoral Council. Doctoral Council registration number at commissioner for data protection: 02003/0001. Program version: 2.2358 ( 2017. X. 31. )