Thesis supervisor: Hussain Alizadeh
co-supervisor: László Pajor
Location of studies (in Hungarian): PTE ÁOK, Pécs, Szigeti u. 12. Abbreviation of location of studies: ÁOK
Description of the research topic:
Nemzetközi adatok azt igazolják, hogy a leggyakoribb malignus lymphomában, a DLBCL-ben szenvedő betegek egy harmada nem gyógyitható meg.
Jelen kutatási program I. altémája ezen betegségcsoport komplex patomorfológiai, fenotipus, citogenetikai, expressziós profil, szignál transzdukciós mutációs valamint klinikai prognosztikai monitorizálását kivánja elvégezni a következők szerint.
1. Retrospektive összesen 300 (100/év) DLBCL-NOS, DLBCL/BL (HGBL) és BL beteg diagnosztikus FFPE blokkján a tumor fenotipus stratifikációja és proliferációs jellemzése történik meg CD5, CD10, BCL2, BCL6, MUM1, C-MYC és MIB1 márkerekkel, IH eljárással, a PTE – KK-ban diagnosztizált és / vagy kezelt beteganyagban.
2. A vizsgált kohorsz szövettani blokkjait genetikailag iFISH eljárással MYC – t(8;14), BCL2 – t(14;18) és BCL6 – 3q27 átrendeződésre / törésre vizsgáljuk.
3. A FFPE szövetblokkokból DNS-t izolálunk más munkacsoport által végzendő, NGS alapú, genomikai vizsgálatokra.
4. A FFPE blokkokból RNS-t izolálunk. Ebből expressziós profil vizsgálatot végzünk el kollaborációban, NanoString technológiával, Pan Cancer Progression / Signal Pathway platformoknak megfelelően vagy sense / antisense NGS eljárással.
5. A kombinált IH és iFISH valamint az expressziós profil adatok alapján a lymphomák homogén betegség csoportjait hozzuk létre. Ezen csoportok klinikai stádium, IPI score, EFS és OS adatait statisztikailag hasonlitjuk össze a prognosztikai csoportok meghatározása érdekében.
A kutatási terv II. altémája alapján a PTE /SMKMOK intézményeiben diagnosztizált és / vagy kezelt diffúz, nagy B sejtes lymphomás (DLBCL) betegeknél elvégzett Primer, Interim és Restaging FDG-PET/CT vizsgálatok képi analízise során a képekből kijelölt VOI-k segítségével meghatározzuk, hogy mely képi koordináták és voxel intenzitások találhatók a léziókban. Minden lézióból 33 statisztikai érték kerül kinyerésre modalitásonként (CT, PET), azaz minden egyes lézió 66 in-vivo statisztikai értékkel válik karakterizálhatóvá. Ezen képi paraméterek statisztikai feldolgozását, prognosztikai, diagnosztikai jelentőségének pontosabb feltérképezését, pathológiai adatokkal történő összevetését tesszük meg vizsgálattípusonként.
Jelen kutatási terv 2 PhD munkát facilitálhat; az egyik a patológiai – molekuláris patológiai vizsgálatokra, a másik a klinikai – radiológiai monitorizálási adatok analizisére vonatkozik.
Röviditések: BL Burkitt lymphoma; DLBCL diffúz nagy B-sejtes lymphoma; FFPE formalin fixed paraffin embedded; HGBL high grade B-sejtes lymphoma; iFISH interfázis fluoreszcens in situ hibiridizáció; IH immunhistologia; IPI international prognostic index; EFS event free survival; NOS not otherwise specified; OS overall survival
Number of students who can be accepted: 1
Deadline for application: 2023-05-19
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Login
