témavezető: Guttman András
helyszín (magyar oldal): Pannon Egyetem, Mérnöki Kar, Bio-nanotechnológiai és Műszaki Kémiai Kutatóintézet helyszín rövidítés: MÜKKI
A kutatási téma leírása:
Az elmúlt évtizedekben egyre nagyobb fény derült a fehérjékhez kötött N-glikánok jelentőségére és ezen komplex szénhidrát struktúrák immunválaszokban betöltött fontos szerepére (sejt-sejt és sejt-mátrix közti interakciók). A glikánok vizsgálata mára már olyan komoly gazdasági területekre gyakorol jelentős hatást, mint a fehérje alapú gyógyszergyártás (monoklonális antitestek, bioszimilárisok), illetve az egészségügy – pl. biomarker kutatás – a korai diagnosztizáláson keresztül. A glikánok élettani jelentőségét jól reprezentálja, hogy a transzlációs folyamatok során több, mint 650 enzim vesz részt a glikoproteinek végleges szerkezetének kialakításában. A glikánok minőségi és mennyiségi meghatározása komoly kihívásokat tartogat – a bonyolult szerkezetük, biokémiai viselkedésük, kis koncentrációjuk és a biológiai mátrix komplexitása miatt –, így vizsgálatuk több lépcsős, összetett mintaelőkészítési és elválasztási módszerek kidolgozását igényli. A Ph.D. hallgató feladata gyors és robusztus mintaelőkészítési módszerek kidolgozása és vizsgálata, első sorban gyógyszeripari glikoproteinek analízisére kapilláris elektroforézissel. Az optimálandó mintaelőkészítési lépések magukba foglalják a glikánok célzott enzimatikus lehasítását a fehérjékről, azok fluorofór ágenssel való megjelölését, valamint a felesleges jelölőanyagtól való tisztítását. Mindezeken túl, a hallgató feladata az előkészített glikán struktúrák azonosítása további specifikus enzimekkel (exoglikozidáz) történő szekvenálással, valamint tömegspektrometriás csatolás segítségével.
előírt nyelvtudás: angol további elvárások: A kutatási téma szorosan kapcsolódik a Transzlációs Glikomika Kutatócsoport tevékenységéhez, ahol szerteágazó kutatómunka folyik a bioanalitikai eljárások és eszközök kifejlesztéséhez kapcsolódóan.