Thesis supervisor: Gergely Nagy
Location of studies (in Hungarian): Debreceni Egyetem Abbreviation of location of studies: DEÁOK
Description of the research topic:
A kromatin alapszerkezetét a DNS és az azt körülvevő hiszton fehérjék képezik. Ezt a szerkezetet a genom RNS-sé átírható és az átírást szabályozó szakaszai törik meg, melyben a DNS-kötő nem-hiszton és módosított hiszton fehérjék játszanak szerepet. A sejtmagban található nem-hiszton fehérjék közül a transzkripciós faktorok képesek közvetlenül és szekvencia-specifikusan a DNS-hez kapcsolódni, ko-faktoraik pedig a hisztonok módosításáért, a különböző szabályozó komplexek kialakulásáért, végsősoron pedig az RNS polimeráz toborzásáért és aktivitásáért felelősek.
Ezen biológiai folyamatok minden szintje tanulmányozható újgenerációs szekvenálással kapcsolt molekuláris biológiai módszerekkel, az általuk nyert nagy mennyiségű adatot pedig a genomi bioinformatika eszközeivel lehet feldolgozni és integrálni. Kutatásunk során az egér csontvelői makrofágok szabályozó régióinak összetételét, e régiók transzkripciós faktorok általi hozzáférhetőségét, továbbá ezek génszabályozó szerepét kívánjuk vizsgálni bioinformatikai módszerekkel. Ezen túlmenően olyan adat is rendelkezésünkre áll, melynek segítségével megállapítható, hogy az emlős sejtekbe juttatott plazmidok felveszik-e a gazdasejtre jellemző kromatinszerkezetet.
Eredményeink közelebbi betekintést nyújthatnak a genom, ill. kromatin működésébe, és általuk a génszabályozás különböző szintjeinek eddig ismeretlen részleteit is feltárhatjuk.
Login
