témavezető: Csermely Péter
helyszín (magyar oldal): Semmelweis Egyetem helyszín rövidítés: SE
A kutatási téma leírása:
A hálózatbiológia egy olyan interdiszciplináris tudományterület, amely komplex rendszerek, például olyan intracelluláris folyamatok vizsgálatát teszi lehetővé, mint a folyadék-folyadék fázisszeparáció („liquid-liquid phase separation”, továbbiakban LLPS).
Az eukarióta sejtek egymástól elhatárolt kompartmentumokból épülnek fel, mely fizikai elhatárolódásnak köszönhetően az egyes biológiai folyamatok hatékonyabban zajlanak le. A membránnal határolt sejtszervecskék mellett megtalálhatóak úgynevezett membrán nélküli organellumok is, melyek fehérjékből, nukleinsavakból, és más szupramolekuláris alkotóelemekből LLPS által szerveződnek reverzibilis módon. Elhelyezkedésüket tekintve megtalálhatóak a sejtmagban (pl. nucleolus), és a citoplazmában is (pl. stressz granulumok, centriolum). Habár ezen struktúrákat már évtizedekkel ezelőtt megfigyelték, pontos funkciójuk, kialakulásuk módja még ma sem tisztázott. Az utóbbi években leírták a membrán nélküli organellumok szerepét többek között a stresszválaszban, a génexpresszió szabályozásában és a jelátvitelben is. A fázisszeparáció eredményeként kialakuló kondenzátumok kórosan átalakulhatnak, felhalmozódásuk aggregátumokhoz, majd betegségek kialakulásához vezethet, ilyen számos neurodegeneratív megbetegedés és egyes ráktípusok. Az LLPS hálózatos vizsgálata hozzájárulhat a folyamatot meghatározó elemek pontos szerepének tisztázásában.
A kutatási terv részei:
1. Az LLPS-asszociált fehérjék (driverek, co-driverek, regulátorok, kliensek) hálózatos vizsgálata humán interaktómban (fehérje-fehérje interakciós hálózatokban), jelátviteli hálózatokban, valamint RNS hálózatokban komparatív hálózattopológiai módszerekkel.
2. Az LLPS-asszociált fehérjék szerepének vizsgálata a rák kialakulása során.
3. A folyadék-folyadék fázisszeparáció modellezése a humán interaktóm strukturális elrendeződésének megváltoztatásával.
4. Potenciális LLPS-asszociált fehérje gyógyszercélpontok azonosítása komparatív hálózattopológiai módszerekkel.
Jelentkezési határidő: 2022-10-10
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
