Antimikrobiális hatású diszulfid minifehérjék szerkezetének, dinamikájának és molekuláris kölcsönhatásainak vizsgálata korszerű NMR és mikrokalorimetriás módszerekkel
Thesis supervisor: Gyula Batta
Location of studies (in Hungarian): Kémia épület fszt. E-18 iroda és B-13 fehérje labor Abbreviation of location of studies: B-13
Description of the research topic:
Több -redős szerkezetű antimikrobiális fehérje (PAF, AFP, NFAP, PAFB, NFAP2, PAFC, NFBP) atomi felbontású szerkezetét és dinamikáját vizsgáljuk az ismeretlen molekuláris hatásmechanizmus felderítésére. Heterológ expresszióval állítunk elő illetve partnereinktől kapunk NMR vizsgálatokra alkalmas 15N és/vagy 13C izotóppal jelölt diszulfid fehérjéket és azok variánsait. A 700 MHz-es multidimenziós NMR spektrumok jelhozzárendelését követően, a spektrumok elemzésével a fehérjék oldatfázisú térszerkezete és belső mozgásaik meghatározhatók. Speciális NMR módszerekkel (pl. telítés-átvitel, NOE) vizsgáljuk az Aspergillus nidulans és az A. niger fonalas gombákból származó membrán-kivonatok és az antifungális fehérjék interakcióit. NMR és ITC ill. DSC mikrokalorimetriai módszerekkel tanulmányozzuk a membránalkotó kis-molekulák (foszfatidil-inozitolok, ergoszterol, kationok: Ca2+, Zn2+) interakcióit fehérjéinkkel, míg a feltételezett fehérje célpontok azonosítása speciális elválasztástechnikát igényelhet. A fehérjék letekeredési folyamatának és gerjesztett állapotainak vizsgálatára hőmérsékleti és kémiai stresszt alkalmazunk, ami lehetőséget ad a fehérjék rejtett dinamikájának feltárására illetve a diszulfid fehérjék rendkívüli stabilitásának megértésére.
Required language skills: angol Number of students who can be accepted: 2
Deadline for application: 2021-05-17
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Login
