 |
|
| Thesis topic proposal |
| |
Description of the research topic:
Új PhD téma célkitűzéseinek rövid összefoglalása
Semmelweis Egyetem Doktori Iskola, Klinikai Orvostudományok Doktori Iskola
13. Program: „Hormonális szabályozó mechanizmusok” (programvezető: Prof. Dr. Igaz Péter, az MTA doktora)
Témavezető: Prof. Dr. Igaz Péter, az MTA doktora
Téma címe: Cirkuláris RNS-ek vizsgálata endokrin daganatokban
Munkacsoportunk az elmúlt években számos vizsgálatot végzett endokrin daganatok, elsősorban mellékvese-daganatok mikroRNS expressziójának vizsgálata terén. A mikroRNS-ek az RNS-interferencia mediátorai, amelyek számos alapvető sejtélettani folyamatban játszanak szerepet, és megváltozott kifejeződésüket több daganattal összefüggésbe hozták [1]. A mikroRNS-ek vizsgálata keretében tanulmányoztuk mind szöveti, mind keringő vérplazma mikroRNS-ek kifejeződését jó- és rosszindulatú mellékvesekéreg daganatokban [2,3], valamint a szöveti mikroRNS-ek expresszióját archivált phaeochromocytoma mintákban [4]. Mellékvesekéreg daganatokban a keringő extracelluláris vezikulák mikroRNS-eit is részletesen vizsgáltuk és a daganatok diagnózisában használható markereket azonosítottunk [5,6]. Mellékvese myelolipomában is kimutattunk e daganatok diagnózisát segítő szöveti és keringő mikroRNS-eket [7].
A mikroRNS-ek és a genetikai/epigenetikai szabályozás komplexitásának új molekulacsoportját képezik a cirkuláris RNS molekulák, amelyek a lineáris mikroRNS-ekkel ellentétben szabad véggel nem rendelkező, így még a mikroRNS-eknél is stabilabb RNS-molekulák [8]. A cirkuláris RNS-ek mind exon, mind intron struktúrákat tartalmazhatnak. A mikroRNS-ekhez kapcsolódó jelentőségük lehet, hogy a mikroRNS-eket megkötve, ún. mikroRNS szivacsként működve a mikroRNS-ek intracelluláris szintjét szabályozhatják, egyben mikroRNS rezervoárként is működhetnek. E mellett riboszómákat kötve a fehérjék bioszintézisében, sőt a gének expressziójában is szerepet játszhatnak.
A circuláris RNS-ek kifejeződése a szövetekben változó, a mikroRNS-ekhez hasonlóan ezek is szövetspecifikusan expresszálódnak. A cirkuláris RNS-ek jelentősége daganatokban intenzív kutatások tárgya, és számos adat van megváltozott kifejeződésükről pl. gliomákban, tüdőrákban, hepatocellularis, colorectalis, gyomor és húgyhólyag carcinomában, emlőrákban és haematologiai rosszindulatú daganatokban is [9]. A cirkuláris RNS-ek reményteli biomarkerek lehetnek a jövőben, hiszen a testfolyadékokban is viszonylag jelentős mennyiségben megtalálhatók [10].
Eddig nem közöltek adatot a cirkuláris RNS-ek szöveti és/vagy keringő formáinak kifejeződéséről a mellékvese daganataiban és a neuroendokrin daganatok köréből sem, melyek Klinikánk tudományos érdeklődésének középpontjában állnak.
Vizsgálataink célja a mellékvese és neuroendokrin daganatok cirkuláris RNS mintázatának vizsgálata mind szöveti (archivált szövettani mintákból), mind plazma mintákban történő tanulmányozásuk révén.
Tervezett módszerek:
1. teljes RNS izolálás archivált, formalin-fixált szövettani preparátumokból és vérplazma mintákból, majd emésztés RNáz H-val, amire a cirkuláris RNS-ek rezisztensek
2. a cirkuláris RNS-ek mintázatának vizsgálata újgenerációs szekvenálással ill. microarray módszerrel
3. validálás valós idejű polimeráz láncreakcióval
4. bioinformatikai elemzés a cirkuláris RNS-ek által befolyásolt útvonalakról, az érintett mikroRNS-ekről és összevetés a mikroRNS-ek expressziós változásaival
A vizsgálatok jelentősége:
A mikroRNS-ekhez hasonlóan a cirkuláris RNS-ek is hatékony markerei lehetnek a daganatok rosszindulatúságának, ami különösen jelentős lehet azon daganatok esetében, melyek szövettani vizsgálata nehéz (pl. mellékvesekéreg daganatok és phaeochromocytomák).
Irodalomjegyzék
1. Malumbres M (2013) miRNAs and cancer: an epigenetics view. Molecular aspects of medicine 34 (4):863-874.
2. Tömböl Z, Szabó PM, Molnár V, Wiener Z, Tölgyesi G, Horányi J, Riesz P, Reismann P, Patócs A, Likó I, Gaillard RC, Falus A, Rácz K, Igaz P (2009) Integrative molecular bioinformatics study of human adrenocortical tumors: microRNA, tissue-specific target prediction, and pathway analysis. Endocrine-related cancer 16 (3):895-906.
3. Szabó DR, Luconi M, Szabó PM, Tóth M, Szücs N, Horányi J, Nagy Z, Mannelli M, Patócs A, Rácz K, Igaz P (2014) Analysis of circulating microRNAs in adrenocortical tumors. Laboratory Investigation 94 (3):331-339.
4. Tömböl Z, Éder K, Kovács A, Szabó PM, Kulka J, Likó I, Zalatnai A, Rácz G, Tóth M, Patócs A, Falus A, Rácz K, Igaz P (2010) MicroRNA expression profiling in benign (sporadic and hereditary) and recurring adrenal pheochromocytomas. Modern Pathology 23 (12):1583-1595.
5. Perge P, Butz H, Pezzani R, Bancos I, Nagy Z, Pálóczi K, Nyírő G, Decmann A, Pap E, Luconi M, Mannelli M, Buzás EI, Tóth M, Boscaro M, Patócs A, Igaz P (2017) Evaluation and diagnostic potential of circulating extracellular vesicle-associated microRNAs in adrenocortical tumors. Scientific Reports 7 (1):5474.
6. Perge P, Decmann A, Pezzani R, Bancos I, Fassina A, Luconi M, Canu L, Tóth M, Boscaro M, Patócs A, Igaz P (2018) Analysis of circulating extracellular vesicle-associated microRNAs in cortisol-producing adrenocortical tumors. Endocrine 59 (2):280-287.
7. Decmann A, Perge P, Nyírő G, Darvasi O, Likó I, Borka K, Micsik T, Tóth Z, Bancos I, Pezzani R, Iacobone M, Patócs A, Igaz P (2018) MicroRNA expression profiling in adrenal myelolipoma. The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, 103, 3522-3530. doi:10.1210/jc.2018-00817
8. Carrara M, Fuschi P, Ivan C, Martelli F (2018) Circular RNAs: Methodological challenges and perspectives in cardiovascular diseases. Journal of Cellular and Molecular Medicine. doi:10.1111/jcmm.13789
9. Xu Z, Yan Y, Zeng S, Dai S, Chen X, Wei J, Gong Z (2018) Circular RNAs: clinical relevance in cancer. Oncotarget 9 (1):1444-1460.
10. Zhang Z, Yang T, Xiao J (2018) Circular RNAs: Promising Biomarkers for Human Diseases. EBioMedicine 34:267-274. doi:10.1016/j.ebiom.2018.07.036
Deadline for application: 2021-05-31 |
|
|
|
|
Login
