Thesis supervisor: Csaba Barta
Location of studies (in Hungarian): Semmelweis Egyetem Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Pathobiokémiai Intézet Abbreviation of location of studies: SE
Description of the research topic:
A Tourette szindrómával összefüggésbe hozható gének és régiók mikroRNS-ek általi szabályozásának vizsgálata, valamint a szabályozás funkcionális karakterizálása.
2.
A kandidáns gének epigenetikai vizsgálata kezelt és kezeletlen neurális sejtvonalakban.
3.
A teljes genomra kiterjedő DNS metiláció változásának vizsgálata kezelt és kezeletlen állatmodellekből származó agymintákban, valamint humán vérmintákban. (A vizsgálatokhoz a következő módszerek kerülnek alkalmazásra: promoter vagy CpG sziget-specifikus microarray, MeDIP szekvenálás, immunfluoreszcens technikák, biszulfitos genom szekvenálás.)
A kutatás leírása:
A szövetspecifikus génexpresszió szabályozásában számos molekuláris mechanizmus vesz részt, beleértve az epigenetikai módosításokat, illetve a nem kódoló RNS-eket (különös tekintettel a mikroRNS-ekre), melyek a betegség patogenezisét befolyásolják. A kandidáns mikroRNS-ek hatását az in silico módszerekkel meghatározott célgénekre, illetve az gének szabályozó régióiban fellelhető génvariánsok befolyását eme regulációra funkcionális vizsgálatokkal kívánjuk megerősíteni. Különböző humán neuronális sejtvonalakon (pl. neuroblastoma IMR32, SH-SY5Y és SK-NF1, valamint retinoblastoma Y79 sejteken) luciferáz riporter-génexpressziós analíziseket tervezünk, kiegészítve RT-PCR, illetve Western blot vizsgálatokkal. A kutatást finanszírozó EU-s Marie Curie projekt keretében egy német gyógyszergyári kollaborációban előállított rágcsáló Tourette modellállatok agymintáiban tervezzük a striatumban létrehozott 6-OH-dopamin lézió hatására létrejövő epigenetikai változások vizsgálatát. A tejes genom metilációt mikroarray technikával, illetve MeDIP szekvenálással vizsgáljuk, a targetek validálására biszulfitos szekvenálást alkalmazunk. A hisztonok módosításait kromatin immunprecipitációval (ChIP) vizsgáljuk. Az állatok léziót követő különböző glutamáterg és dopaminerg szerekkel való kezelését követően szintén vizsgáljuk az epigenetikai változásokat.
Deadline for application: 2019-11-05
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Login
