Thesis supervisor: Erzsébet Fekete
Location of studies (in Hungarian): DE TTK Biomérnöki Tanszék Abbreviation of location of studies: D-207
Description of the research topic:
A spliceoszómális intronok eukarióta génekben találhatók, kivágásukhoz egy összetett rendszerre van szükség, mely kis RNS molekulákból és fehérjékből tevődik össze. A közelmúltban fonalas gombákban újszerű struktúrájú megszakító szekvenciákat találtunk, melyeket spliceoszómális iker-intronoknak (stwintron) neveztünk el. Az stwintronokban a belső intron kivágódásának meg kell előznie a külső intron kivágódását. Az stwintronok az első példái annak a jelenségnek, hogy egyes sejtmagi gének transzkriptumainak intronjai egymást követő lépések során vágódnak ki. Szeretnénk megismerni a kivágódás alapelveit és működési mechanizmusait, illetve megpróbálni megérteni a funkcionális szempontokat. Az stwintronok már létező intronok mutációja során véletlenszerűen is kialakulhattak, de kutatásaink arra is rávilágíthatnak, hogy vajon rendelhetők-e hozzájuk specifikus funkciók az alternative splicing vagy általánosságban a génkifejeződés szabályozása kapcsán. Kivágódási mechanizmusaiknak, előfordulásuknak és elterjedésüknek az ismerete segíthet megérteni az eukarióta spliceoszómális intronok képződését és működését.
A témáról a Biomérnöki Tanszéken írott publikációk:
1) Fekete E, Flipphi M, Ág N, Kavalecz N, Cerqueira G, Scazzocchio C, Karaffa L. (2017): A mechanism for a single nucleotide intron shift. Nucleic Acids Research, 45: 9085-9092. IF: 11.908
2) Flipphi M, Ág N, Karaffa L, Kavalecz N, Cerqueira G, Scazzocchio C, Fekete E (2017): Emergence and loss of spliceosomal twin introns. Fungal Biology and Biotechnology, 4: 7.
3) Flipphi M, Fekete E, Ág N, Scazzocchio, C, Karaffa L (2013): Spliceosome twin introns in fungal nuclear transcripts. Fungal Genetics and Biology, 57: 48-57. IF: 3.262
4) Ág N, Flipphi M, Karaffa L, Scazzocchio C, Fekete E (2015): Alternatively spliced, spliceosomal twin introns in Helminthosporium solani. Fungal Genetics and Biology, 85: 7-13. IF: 2.587
Recommended language skills (in Hungarian): angol Further requirements: Biomérnök/Biológus/Biotechnológus MSc végzettség, MSc szintű mikrobiológiai, genetikai és molekuláris biológiai jártasság
Number of students who can be accepted: 2
Deadline for application: 2019-05-15
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Login
