Thesis supervisor: Orsolya Dobay
Location of studies (in Hungarian): SE Orvosi Mikrobiológiai Intézet Abbreviation of location of studies: SE
Description of the research topic:
Elérni kívánt célok:
• A kisgyerekek által hordozott pneumococcusoknál megfigyelhető dinamikus szerotípus változások nyomonkövetése a konjugált vakcináció (PCV-7 / PCV-13) széleskörű magyarországi elterjedésének első éveiben
• A hordozott és klinikai pneumococcus izolátumok szerotípusainak és egyéb epidemiológiai jellemzőinek összehasonlítása
• A S. aureus kolonizáció felmérése (antibiotikum rezisztencia, virulenciafaktorok, toxintermelés, fágtípusok, klonalitás) egészséges emberekben, az eredményesebb infekciókontroll bevezetése érdekében
• A S. aureus kolonizáció felmérése házi kedvencekben és gazdáikban, valamint állatorvosi rendelők munkatársaiban; különös tekintettel az antibiotikum rezisztencia gének átadásának vizsgálatára illetve bizonyos klónok állatról emberre való terjedésének kimutatására
• S. pneumoniae és S. aureus együttes hordozásának vizsgálata kisgyerekekben, különös tekintettel a konjugált pneumococcus vakcinák és a pneumococcus pílusok befolyásoló hatására
• Várandós nőkből és újszülöttekből származó Str. agalactie (GBS) izolátumok vizsgálata, a szerotípusok, virulenciafaktorok és virulens klónok meghatározása, ennek eredményeire alapozva hatásosabb hazai szűrő- és prevenciós program kidolgozása
• GBS izolátumok antibiotikum érzékenységének meghatározása, különös tekintettel a hordozás során a normál flóra tagoktól kapott “néma” makrolid rezisztencia gének jelenlétére, amelyek kezelés során fellépő klinikai rezisztenciához vezethetnek
• Mikrobióm kutatás: orr-, torok-, illetve hüvelyflóra összetételének vizsgálata különböző gazda (hordozó vagy beteg) paraméterek esetén
Alkalmazott módszerek:
• Antibiotikum érzékenység: MIC mérés agarhigításos módszerrel, mikrodilúcióval
• Szerotipizálás: agglutinációs és tokduzzadásos tesztekkel (savókkal), PCR-rel.
• Genotipizálás: pulsed-field gél elektroforézis (PFGE); multilocus sequence typing (MLST)
• Virulenciagének, toxin gének, antibiotikum rezisztencia gének kimutatása PCR-rel: primerek tervezése, PCR ciklusok beállítása, gélfuttatás.
• S. aureus: SCCmec tipizálás PCR-rel.
• Szekvenálás: más laborban.
• Génexpresszió vizsgálata: real-time PCR-rel (más laborban), northern blot módszerrel.
• Mikrobióm elemzés: DNS kinyerése légúti mintából, könyvtár készítés, teljes genom szekvenáltatás.
Deadline for application: 2019-01-30
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Login
