Thesis supervisor: Katalin Kövér
Location of studies (in Hungarian): DE TTK Szervetlen és Analitikai Kémai Tanszék Kémia épület E-19, NMR laboratórium Abbreviation of location of studies: E19
Description of the research topic:
A kutatás célja különböző biológiai funkcióval rendelkező modell peptidek/fehérjék szerkezetének, dinamikájának jellemzése és kölcsönhatásainak vizsgálata NMR-spektroszkópiai módszerekkel és elméleti számításokkal.
Vizsgálni tervezett rendszerek:
(1) fotolitikus hasításra érzékeny, diszulfid-hidat tartalmazó fehérjék peptid modelljeinek részletes szerkezetvizsgálata NMR, CD és molekuladinamika számítások kombinált alkalmazásával a fotolitikus redukció szerkezeti/dinamikai aspektusainak megismerése céljából.
(2) a sejtdifferenciáció szabályozásában szerepet játszó, in silico tervezett peptid/fehérje modellek szerkezet-dinamika-kölcsönhatás/biológiai funkció kapcsolatának vizsgálata.
A molekuláris felismerésért felelős kölcsönhatások atomi szintű vizsgálatára, a peptid-fehérje komplexek szerkezetének felderítésére, a kölcsönhatásért felelős funkciós csoportok kimutatására, a kötőhely feltérképezésére, a kölcsönhatás dinamikai jellemzőinek meghatározására ligandum- illetve fehérje-detektáláson alapuló NMR technikákat alkalmazunk, illetve azokat szükség szerint továbbfejlesztjük. 15N-jelölt peptid/fehérjevariánsok NMR relaxációs paramétereinek mérése révén vizsgáljuk a dinamika hatását a sejtdifferenciáció folyamatára. A dinamika és a biológiai hatás közti összefüggés elemzése lehetővé teszi a sejtdifferenciációnak peptid-analógokkal történő szabályozását, és ezáltal potenciális gyógyhatású készítmények kifejlesztését.
Required language skills: angol Further requirements: számítógépes ismeretek