Login
 Forum
 
 
Thesis topic proposal
 
Katalin Kövér
Peptid modellek és peptid-fehérje kölcsönhatás vizsgálata NMR-spektroszkópiával és számítógépes molekulamodellezéssel

THESIS TOPIC PROPOSAL

Institute: University of Debrecen
chemistry
Doctoral School of Chemistry

Thesis supervisor: Katalin Kövér
Location of studies (in Hungarian): DE TTK Szervetlen és Analitikai Kémai Tanszék Kémia épület E-19, NMR laboratórium
Abbreviation of location of studies: E19


Description of the research topic:

A kutatás célja különböző biológiai funkcióval rendelkező modell peptidek/fehérjék szerkezetének, dinamikájának jellemzése és kölcsönhatásainak vizsgálata NMR-spektroszkópiai módszerekkel és elméleti számításokkal.
Vizsgálni tervezett rendszerek:
(1) fotolitikus hasításra érzékeny, diszulfid-hidat tartalmazó fehérjék peptid modelljeinek részletes szerkezetvizsgálata NMR, CD és molekuladinamika számítások kombinált alkalmazásával a fotolitikus redukció szerkezeti/dinamikai aspektusainak megismerése céljából.
(2) a sejtdifferenciáció szabályozásában szerepet játszó, in silico tervezett peptid/fehérje modellek szerkezet-dinamika-kölcsönhatás/biológiai funkció kapcsolatának vizsgálata.
A molekuláris felismerésért felelős kölcsönhatások atomi szintű vizsgálatára, a peptid-fehérje komplexek szerkezetének felderítésére, a kölcsönhatásért felelős funkciós csoportok kimutatására, a kötőhely feltérképezésére, a kölcsönhatás dinamikai jellemzőinek meghatározására ligandum- illetve fehérje-detektáláson alapuló NMR technikákat alkalmazunk, illetve azokat szükség szerint továbbfejlesztjük. 15N-jelölt peptid/fehérjevariánsok NMR relaxációs paramétereinek mérése révén vizsgáljuk a dinamika hatását a sejtdifferenciáció folyamatára. A dinamika és a biológiai hatás közti összefüggés elemzése lehetővé teszi a sejtdifferenciációnak peptid-analógokkal történő szabályozását, és ezáltal potenciális gyógyhatású készítmények kifejlesztését.

Required language skills: angol
Further requirements: 
számítógépes ismeretek


Deadline for application: 2018-05-15

 
All rights reserved © 2007, Hungarian Doctoral Council. Doctoral Council registration number at commissioner for data protection: 02003/0001. Program version: 2.2358 ( 2017. X. 31. )