Login
 Forum
 
 
Thesis topic proposal
 
László Kozma-Bognár
Növényi cirkadián óra-fehérjék SUMO-módosításának funkcionális vizsgálata

THESIS TOPIC PROPOSAL

Institute: University of Szeged
biology
Doctoral School of Biology

Thesis supervisor: László Kozma-Bognár
Location of studies (in Hungarian): MTA SZBK
Abbreviation of location of studies: SzBK


Description of the research topic:

A növényi cirkadián óra magját, más eukariotákhoz hasonlóan, az ún. óra-gének és az általuk kódolt óra-fehérjék alkotják, amelyek egymás működését szabályozva egy önfenntartó, mintegy 24 órás ritmust alakítanak ki saját kifejeződésük szintjén. Ez az alap-ritmus megfelelő jelátviteli utakon keresztül számos életfolyamat megjelenésében okoz 24 órás oszcillációkat. Az óra legfontosabb funkciója, hogy az általa szabályozott molekuláris/élettani folyamatokat arra a napszakra időzíti, amikor azokra leginkább szükség van (erőforrások gazdaságos felhasználása), vagy szükség lehet (előrejelzés, megelőzés). E feladat ellátásához alapvető fontosságú a megfelelő és stabil periódus kialakítása, amihez nagyban hozzájárul az óra-fehérjék poszt-transzlációs módosítása. A legkevésbé tanulmányozott ezek közül a szumoiláció, amelynek során egy ubikvitinhez hasonló kis fehérje (Small Ubiquitin-like Modifier = SUMO) kapcsolódik a célfehérjéhez, ami hatással van annak funkciójára, kölcsönhatásaira, sejten belüli elhelyezkedésére, vagy stabilitására. A tervezett projekt során a növényi (Arabidopsis thaliana) cirkadián óra működésében alapvető szerepet játszó fehérjék SUMO-módosítását, valamint annak molekuláris és élettani következményeit vizsgáljuk. Kísérleteink során megvizsgáljuk, hogy mely óra-fehérjékhez konjugálható SUMO egy in vitro szumoilációs rendszerben, majd a prediktált szumoilációs helyek elrontásával, majd ismételt tesztekkel olyan mutáns fehérjéket hozunk létre, amelyekhez nem kapcsolható SUMO. A mutáns fehérjéket a megfelelő óra-mutáns növényekben fejeztetjük ki. A transzgenikus növényeket részletes molekuláris és élettani vizsgálatoknak vetjük alá, amelyek megmutatják, hogy pontosan milyen folyamatok szabályozásában van szerepe az adott óra-fehérjék SUMO-módosításának. Ezzel párhuzamosan komplex biokémiai módszerek (fúziós fehérjék termeltetése, fehérjetisztítás, immuno-precipitáció, Western-blot) alkalmazásával kiderítjük, hogy milyen belső és külső tényezők szabályozzák az óra-fehérjék SUMO-módosítását in vivo. Eredményeink új és alapvető információkat szolgáltatnak majd arról, hogy miképpen járul hozzá a SUMO-módosítás a növényi cirkadián óra pontosabb működéséhez.

Recommended language skills (in Hungarian): angol
Number of students who can be accepted: 1

Deadline for application: 2016-12-31


2024. IV. 17.
ODT ülés
Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).

 
All rights reserved © 2007, Hungarian Doctoral Council. Doctoral Council registration number at commissioner for data protection: 02003/0001. Program version: 2.2358 ( 2017. X. 31. )