témavezető: Bálint Bálint László
helyszín (magyar oldal): Semmelweis Egyetem helyszín rövidítés: SE
A kutatási téma leírása:
Összefoglaló
Az elmúlt évtízed során nagy mennyiségű onkogenomikai adat vált nyilvánosan elérhetővé. Az adatok feldolgozása folyamatos. A génexpresszió szabályozásban szerepet játszó kromatin szintű adatok feldolgozása csak részben történt meg. Ezen kromatin szintű génexpresszió szabályozó mechanizmusok alkalmasak onkoterápiás hasznosításra amit jelez, hogy számos epigenetikai támadáspontú gyógyszert már használnak daganatkezelésekben. A kutatás során a kromatin szintű poszttranszlációs módosítások onkodiagnosztikus és onkoterápiás vonatkozásait célozzuk jobban megismerni.
A javasolt téma szakirodalmi megalapozottsága
Az elmúlt néhány évben több onkológiai szempontból releváns transzlokációról sikerült bizonyítani, hogy egy sejtspecifikus, magas aktivitással rendelkező szuperenhanszer és egy onkogén fúziója által indítják be a daganatsejtek proliferációját[1]. A szuperenhanszerek kromatin szintű markerekkel bioinformatikai módszerekkel azonosíthatóak. A szuperenhanszerek működésének kulcsfehérjéit most térképezik, esetenként gátló kismolekulák is elérhetőek [2]. Ilyen kulcsfehérje a BRD4 mely egy bromodomén fehérje, szerepe az acetilált hiszton végek felismerése és ezáltal az enhanszer és promóter régiók összekapcsolása. Jelenleg több klinikai vizsgálat zajlik a BRD4 gátlószerek hatékonyságának tesztelésére malignus betegségekben[3].
Munkacsoportunk kimutatta, hogy a COUP-TFII transzkripciós faktor expressziós szintje több daganat esetén markánsan befolyásolja a betegek prognózisát[4]. Vizsgálatunkban sikerült kimutatni, hogy a COUP-TFII egyrészt sejtspecifikus genetikai programokat modulál, másrészt részt vesz a CTCF által kialakított kromatin hurkokban és ezáltal több angiopoetikus gén expresszióját befolyásolja[5].
Tervezett kutatásunk során a szuperenhanszerek működésének további részleteit kívánjuk megismerni döntően szolid tumorokban. Kiemelt figyelmet fogunk szentelni az emlődaganatnak a következő szempontok miatt: jelentős mennyiségű multi-omikai adat érhető el. Jelentős alapkutatások molekuláris szinten térképeztek már több emlődaganat sejtes modellt és ezen adatok szabadon elérhetőek további kutatások számára. Kiegészítve a jelentős számú klinikai genomikai projekttel, jó esély van a szuperenhanszerek szerepének jobb megismerésére a szolid tumorok kialakulásában, sztratifikációjában és új kezelési megközelítések azonosításában.
Jelentkezési határidő: 2024-11-01
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
