témavezető: Szécsényi-Nagy Anna
helyszín (magyar oldal): HUN-REN Bölcsészettudományi Kutatóközpont, Archeogenomikai Intézet (BTK AGI) (Budapest, 1097 Tóth Kálmán utca 4.) helyszín rövidítés: H-REN
A kutatási téma leírása:
"Az archeogenetika tudományterületén belül napjainkban egyre hangsúlyosabb szerepet kap a bioinformatika, az archaikus genomi adatok különböző feldolgozási lehetőségeinek fejlesztése.
Az Archaeogenomikai Intézet kutatócsoportja a közelmúltban kifejlesztett egy nyers DNS adatok feldolgozására szolgáló informatikai rendszert, olyan kapcsolódó eszközökkel, amelyek például monitorozzák a minták tisztaságát, vagy segítik az öröklődő betegségek és a fenotípushoz kapcsolható genetikai markerek nyomon követését (Gerber et al. 2023). A jelen PhD kutatás központi témája az ősi genomok mélyebb elemzéséhez hasznos további módszerek tesztelése, adaptálása és fejlesztése. A doktori munka egyik lehetséges iránya a populációgenetikai, a másik pedig a genetikai betegségek és egyes genomi régiók genetikai szelekciójának kutatása ősi populációkban. A hallgató feladata lesz a gépi tanulás lehetőségeinek és alkalmazásának felderítése az archaeogenetikai kutatásokban, így a téma informatikai érdeklődést és erős statisztikai alapokat kíván.
A PhD munkához bioinformatikai és Linux operációs rendszer alapismeretekre, R vagy Python programozási alapismeretekre van szükség.
A kutatáshoz az infrastruktúrát az BTK Archeogenomikai Intézetének laboratóriuma biztosítja.
"
előírt nyelvtudás: magyar, angol további elvárások: biológus, biomérnök, fizikus vagy biofizikus végzettség (MSc), bioinformatikai alapismeretek, Linux operációs rendszer ismeretek, alapvető programozási és biostatisztikai ismeretek
felvehető hallgatók száma: 1
Jelentkezési határidő: 2024-05-31
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
