témavezető: Tusnády Gábor
helyszín (magyar oldal): Természettudományi Kutatóközpont, Enzimológiai Intézet helyszín rövidítés: H-REN
A kutatási téma leírása:
Bár az elmúlt években az AlphaFold2 és más mesterséges intelligenciát felhasználó eljárások óriási áttörést hoztak a fehérjeszerkezetek modellezésében és ezen eljárások segítségével ma már összes élőlény proteomját meghatározó fehérje szerkezetét sikerült modellezni monomer szinten, a fehérjék közötti átmeneti és statikus kapcsolatok, valamint ezen komplexek szerkezetének meghatározása még mindig óriási kihívást jelent a tudomány számára. A transzmembrán fehérjékre ez a kihívás még nehezebb, figyelembe véve, hogy a fenti eljárások a szerkezet becslés során a kettős lipid réteg által támasztott sztérikus megszorításokat egyáltalán nem veszik figyelembe, így számos olyan modellt becsülnek, amelyek a membránba ágyazott fehérjék esetén biztosan hibásak. A doktori képzés során olyan bioinformatikai, mesterséges intelligenciát felhasználó eljárásokat kívánunk fejleszteni, amelyek alkalmasak a transzmembrán fehérjék esetében mind a statikus homo és heterooligomer komplexek szerkezetének modellezésére, mind ezen fehérjék közötti tranziens kölcsönhatások feltérképezésére.
előírt nyelvtudás: angol további elvárások: C, C++, python vagy PHP ismerete
felvehető hallgatók száma: 2
Jelentkezési határidő: 2024-05-31
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
