témavezető: Kovács Tamás
társ-témavezető: Rákhely Gábor
helyszín (magyar oldal): Enviroinvest Zrt, 7632 Pécs, Kertváros u., SZTE TTIK Biotechnológiai Tanszék helyszín rövidítés: SZTE
A kutatási téma leírása:
A bakteriofágok (fágok) a baktériumokat fertőző objektumok. A bakteriofágok specifikusak a gazdabaktériumra (akár fajon belüli kategóriákra is), növényvédelmi célú alkalmazásuk minimális beavatkozást jelent a környezetbe. A lizogén életciklussal rendelkező bakteriofágok a baktériumok közötti horizontális géntranszfer fő okozói, ezért bakteriofág-alapú biokontroll céljára obligát lítikus bakteriofágokat alkalmazunk, melyek nem rendelkeznek lizogén életciklussal.
A Xanthomonadaceae családba tartozó fajok potens növénypatogén baktériumok, melyek közel 400 gazdanövény fajt képesek fertőzni. Az egyes fajok különböző törzsei eltérő mértékben képesek megbetegíteni a gazdanövényt. A Xanthomonas spp. fajok törzseinek patogenitását több tényező befolyásolja, közülük az extracelluláris poliszacharidok, lipopoliszacharidok, adhezinek, és az effektor fehérjék eltérő szintézisét és eszköztárát érdemes kiemelni.
A Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) Gram-negatív baktérium, mely a káposztafélék feketeerűségét okozza. Jelentős gazdasági károkkal jár a fertőzés. A megbetegedések rézzel és/vagy antibiotikumokkal kontrollálhatóak, de ezeknek komoly környezeti hatása van, mely együtt a kezeléssel szembeni rezisztencia megjelenésével más irányú megoldásokra ösztönzi a kutatásokat.
A projekt során izolálunk és jellemzünk Xcc-t fertőző olyan bakteriofágokat, melyek potenciálisan biokontrollban alkalmazhatóak. A jellemzés során a hagyományosan alkalmazott vizsgálatokon (lizogének kiszűrése, gazdaspecificitás, morfológia, teljes genom szekvenálása) kívül nagy hangsúlyt fogunk fektetni a különböző bakteriofágokat tartalmazó koktélok összeállítására. Ennek során qPCR módszerrel mérjük a koktélt alkotó különböző bakteriofágok fertőzés során egymásra gyakorolt hatását (szinergikus, antagonisztikus, semleges), illetve meghatározzuk a fágok receptor-specificitását. E mellett összefüggéseket keresünk a különböző mértékben patogén Xcc törzsek genomja által kódolt patogenitási faktorok és e törzsek bakteriofágokkal való fertőzhetősége között. Célunk olyan fágkoktélokat összeállítani, melyek obligát lítikus életciklusssal rendelkező, széles gazdaspecificitású, különböző gazdareceptorokat felismerő, egymással nem antagonisztikus bakteriofágokat tartalmaznak, és melyek elsősorban a nagyobb mértékben patogén Xcc tözseket képesek megfertőzni. A projekt eredményeként célunk egy olyan vizsgálati sorrend létrehozása, mely elveit más Xanthomonas fajok elleni bakteriofág-alapú biokontroll létrehozásához is alkalmazni lehet
előírt nyelvtudás: magyar felső és angol középfok ajánlott nyelvtudás (magyar oldal): angol felsőfok felvehető hallgatók száma: 1
Bejelentkezés
