témavezető: Ari Eszter
helyszín (magyar oldal): Eötvös Loránd Tudományegyetem, Genetikai Tanszék (Budapest) és Szegedi Biológiai Kutatóközpont, Biokémiai Intézet (Szeged) helyszín rövidítés: ELTE
A kutatási téma leírása:
A kutatás célja, az online elérhető adatok alapján, illetve új-generációs szekvenálási módszerek segítségével az antibiotikumokhoz való alkalmazkodás, valamint a virulencia változásának vizsgálata. Mindennek során az orvostudomány és farmakológia egyik égető kérdésére keressük a választ. Vizsgáljuk, hogy miért találunk különbségeket az egyes rezisztencia és virulencia gének horizontális terjedésében, taxonómiai eloszlásában. Ezeknek a különbségeknek a megértése befolyással lehet az újonnan piacra kerülő antibiotikumok tervezésére és a velük szemben, a kórokozókban kialakuló ellenállás lehetőségének minimalizálására. A kutatás részét képezi a megfelelő bioinformatikai eljárások kidolgozása és a további kutatásokat segítő modellek fejlesztése. A kutatás az MTA Szegedi Biológiai Kutatóközpontjának Szintetikus és Rendszerbiológiai Egységével (http://group.szbk.u-szeged.hu/sysbiol/) kollaborációban zajlik.
előírt nyelvtudás: angol további elvárások: Bioinformatikai készségek; programozás shell-ben, R-ben vagy pythonban; a genomika és az evolúciós alapvetések ismerete