Bejelentkezés
 Fórum
 
 
Témakiírás
 
Villányi Zoltán
Transzlációs hibák felderítése és célzása tumorsejtekben.

TÉMAKIÍRÁS

Intézmény: Szegedi Tudományegyetem
elméleti orvostudományok
Multidiszciplináris Orvostudományok Doktori Iskola

témavezető: Villányi Zoltán
webcím: https://biokemia.bio.u-szeged.hu/index_e.html
helyszín (magyar oldal): SZTE TTIK Biokémiai és Molekuláris Biológia Tanszék
helyszín rövidítés: BMBT


A kutatási téma leírása:

A genomi instabilitás nagy mértékben hozzájárul az egészséges sejtek rákos sejtekké történő átalakulásához. A mai napig nem ismert, hogy a tumorsejtek milyen módon védik ki a genom átrendeződésének következtében fellépő géndózistöbblet okozta toxikus hatásokat. Érdekesség a rákos sejtekkel kapcsolatban, hogy gyakran halmoznak fel mutációkat riboszóma-alegységeket kódoló fehérjékben. Az RPL5, RPL10 és az RPL22 alegységek például a T sejtes akut limfoblaszt leukémiás (T-ALL) betegek kb. 20%-ánál mutációt szenvednek. Szolid tumorok esetében ez a szám 10% és 35% közötti. Az RPL5 és RPL10 szomszédos fehérjék a riboszóma struktúráján belül, ott, ahol az mRNS-ek dekódolása, tRNS-ekkel történő találkozása zajlik. Ismeretes, hogy az RPL10 Arg98Ser mutációja az aminosav beépülések kodonhűségére hat, azaz olyan aminosavak beépülését teszi lehetővé a polipeptidláncba, amelyek az mRNS-en kódolva sincsenek. Könnyen belátható, hogy ez hibás fehérjeérési folyamatokhoz, végső soron funkciójukat ellátni képtelen fehérjék képződéséhez vezet.
A Ccr4-Not komplex is gyakran mutálódik rákos sejtekben, T-ALL sejtekben például a betegek 8%-ában mutatható ki mutációja. Ez a komplex hosszú éveken át jóformán csak úgy volt ismeretes, mint az eukarióták legfőbb deadenilációs komplexe. Az elmúlt 5 évben kiderült, hogy a Ccr4-Not fehérjekomplexek kotranszlációs összeszerelődésében is szerepet játszik, oly módon, hogy egy platformot biztosít a kotranszlációs folyamatok végbemeneteléhez. Ez jelenthet fehérje-chaperon, vagy fehérje-fehérje kotranszlációs összeszerelődést is, amennyiben egy komplexen belüli szomszédos fehérjékről van szó. A Ccr4-Not komplex Not5 alegységének hiányában megfigyeltük, hogy fehérjeösszeszerelődési köztes termékek halmozódnak fel a citoplazmában, gyakran aggregálódva.
HIPOTÉZIS ÉS CÉLKITŰZÉS
Célunk, hogy kiderítsük, a kotranszlációs folyamatokban szerepet játszó fehérjék mutációi tumorsejtekben hozzájárulnak-e a genomi instabilitás miatt kialakuló géndózistöbblet toxikus hatásainak kivédéséhez. Elsősorban olyan fehérjék azonosítását tűztük ki célul, amelyek nagy mennyiségben aggregálódnak, nem esszenciálisak, és érésükhöz chaperonokra van szükség. Elméletünk szerint a folyamatos fehérjeaggregáció leterheli a chaperonrendszert, és globális fehérjeérési problémákhoz vezet, ami a korábban evolválódott génekről kifejeződött fehérjéket kevésbé sújtja. Ha a nem esszenciális aggregálódó fehérjék expresszióját gátolnánk, felszabadíthatnánk a leterhelt chaperonrendszert, ami következésképpen olyan folyamatok helyreállítását tenné lehetővé, amelyek apoptózishoz, vagy a toxikus géndózistöbblet megnyilvánulásához vezetnének rákos sejtekben. Célunkat a következő kísérletes megközelítésekkel kívánjuk elérni:
1. Abundánsan aggregálódó fehérjék azonosítása riboszóma és Crr4-Not mutáns élesztőmodell és tumorsejtvonal sejtekben.
2. Fehérjeaggregáció vizsgálata betegekből származó szövetmetszeteken és tumormintákban.
3. Nem esszenciális abundáns fehérjék aggregációjának tumorsejtek életképességére gyakorolt hatásának vizsgálata.

előírt nyelvtudás: angol
további elvárások: 
TDK munka

felvehető hallgatók száma: 1

Jelentkezési határidő: 2023-06-12


2024. IV. 17.
ODT ülés
Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).

 
Minden jog fenntartva © 2007, Országos Doktori Tanács - a doktori adatbázis nyilvántartási száma az adatvédelmi biztosnál: 02003/0001. Program verzió: 2.2358 ( 2017. X. 31. )