témavezető: Csermely Péter
helyszín (magyar oldal): Semmelweis Egyetem helyszín rövidítés: SE
A kutatási téma leírása:
A hálózattudomány korunk intenzíven fejlődő interdiszciplináris tudományterülete, amellyel komplex rendszereket vizsgálhatunk, mint például a daganatok kialakulása és progressziója. Hálózatkutatási módszerekkel a biológiai adathalmazok hatékonyan elemezhetővé válnak, és másképp nem fellelhető összefüggések ismerhetőek fel bennük.
A kutatómunka célja különböző ráktípusokból származó (pl. prosztatarák, nyelőcsőrák, gyomorrák, hasnyálmirigyrák) multiomikai adatok hálózatos elemzése, lehetőség szerint az eredmények kísérletes validálása. A kutatás fókuszában a daganatok kialakulásának folyamata, azok progressziójának jelei (pl. EMT), valamint gyógyszerrezisztencia mechanizmusai állnak. Ehhez transzkriptomikai (RNASeq, microarray) és proteomikai (LC-MS/MS) adatokat, valamint humán jelátviteli, ill. fehérje-fehérje interakciós hálózatokat használunk fel. Ily módon létrehozható lehet akár egy adott ráktípusra specifikus sejt hálózatos modellje.
A kutatási terv magába foglalja:
1. A hálózat struktúrájában kiemelt szerepet játszó modulok, csomópontok, a modulok-közti hidak és átfedések vizsgálatát, melyek kritikus szereppel bírnak a hálózat megváltozott környezeti hatásokra adott adaptív válaszaiban, így akár potenciális gyógyszercélpontok is lehetnek.
2. Keressük azokat a specifikus kapcsolatokat is, amelyek a hálózatok perifériáján újonnan keletkeznek, így a hálózatban azelőtt egymástól távol lévő nódusokat "zárnak rövidre". Ezek a kapcsolatok új jelátviteli utakat nyithatnak meg.
3. Az in silico analízisek által azonosított, a daganatprogresszióban potenciálisan fontos szerepet játszó gének in vitro validálására is lehetőség nyílhat.
Jelentkezési határidő: 2022-10-10
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
