témavezető: Bodai László
helyszín (magyar oldal): Szegedi Tudományegyetem, Természettudományi és Informatikai Kar, Biokémiai és Molekuláris Biológiai Tanszék helyszín rövidítés: SZTE
A kutatási téma leírása:
Az egy-sejt RNS szekvenálás (scRNA-seq) lehetővé teszi egyedi sejtek egy adott időpillanatban megfigyelhető mRNS transzkriptómjának leírását. Különböző sejttípusokba tartozó nagyszámú sejten alapuló scRNA-seq adatgyűjtéssel fontos genetikai információkat hordozó génexpressziós mátrixokat hozhatunk létre. Az elmúlt évtized során az adatgyűjtés és a génexpressziós mátrixok létrehozása nagy lépésekben fejlődött, azok a bioinformatikai eszközök azonban, amelyek szükségesek az ezekből az adatokból kinyerhető tudományos információ maximalizálásához jelenleg is fejlesztés alatt állnak, és a bioinformatikai analízis munkafolyamatait szinte minden tudományos kérdésre egyedileg rá kell szabni. Ennek a kutatási projektnek a célja olyan bioinformatikai munkafolyamatok fejlesztése és megvalósítása, amelyek alkalmasak scRNA-seq adatok hatékony feldolgozására; továbbá a fejlesztett munkafolyamat újonnan létrehozott és már létező adathalmazokon való alkalmazásával új biológiai összefüggések feltárása.
előírt nyelvtudás: magyar, angol ajánlott nyelvtudás (magyar oldal): magyar, angol további elvárások: Gyakorlati jártasság bioinformatikai módszerekben. Szakirodalom önálló értelmezésének képessége.
felvehető hallgatók száma: 1
Jelentkezési határidő: 2021-12-31
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
