Bejelentkezés
 Fórum
 
 
Témakiírás
 
Archaikus minták teljes genom szekvenciáinak analízise, bioinformatikai feldolgozása

TÉMAKIÍRÁS

Intézmény: Szegedi Tudományegyetem
elméleti orvostudományok
Multidiszciplináris Orvostudományok Doktori Iskola

témavezető: Maróti Zoltán
helyszín (magyar oldal): SZTE ÁOK Gyermekgyógyászati Klinika
helyszín rövidítés: ÁOK


A kutatási téma leírása:

Az archeogenetika a fosszilis DNS molekuláris genetikai módszerekkel történő vizsgálatával foglalkozik. Jelen kutatásunkban 274 archaikus Hun, Avar, Honfoglalás kori, illetve 10-12 századi Magyar leletből származó teljes genom szekvencia feldolgozása, és populáció genetikai analízise. A szekvenciák zöme átlagosan 2-6x átlag lefedettségű, így a filogenetikai elemzés (teljes mitogenom, mély Y tipizálás) mellett lehetőség nyílik a teljes genomból történő populáció genetikai analízisekre (principal komponens analízis (PCA), admixture analízis, F statisztikák, qpAdm, stb). Kutatásunk célja a Kárpát medence genetikai összetételének vizsgálata a 3-ik századtól a 12-ik századig. A kutatásba bevont doktorandusz részt vesz a populáció genetikai elemzések elsajátításában, kivitelezésében és a genom szekvenciák analíziséhez, minőségi szűréséhez szükséges bioinformatikai „pipeline”-ok kialakításában.

előírt nyelvtudás: angol B2 komplex nyelvvizsga
további elvárások: 
TDK munka végzése

felvehető hallgatók száma: 3

Jelentkezési határidő: 2022-04-06

 
Minden jog fenntartva © 2007, Országos Doktori Tanács - a doktori adatbázis nyilvántartási száma az adatvédelmi biztosnál: 02003/0001. Program verzió: 2.2358 ( 2017. X. 31. )