témavezető: Turiák Lilla
helyszín (magyar oldal): Semmelweis Egyetem helyszín rövidítés: SE DI
A kutatási téma leírása:
Bioanalitikai és szerkezetkutatási módszerek kidolgozása és alkalmazása a kulcslépése különböző minták (így pl. vérplazma, sejtek, szövetek, extracelluláris vezikulumok) molekuláris komponenseinek részletes azonosítására. Ebben a folyamatban a tömegspektrometriának, főleg kromatográfiával csatolva kitüntetett szerepe van, mert az egyik legnagyobb teljesítőképességű modern analitikai eljárás. Az elmúlt években a fejlett tömegspektrometriás technikákkal végzett „omika-i” kutatások ma már nélkülözhetetlen elemei az orvosi, sejtbiológiai és biomarker vizsgálatoknak.
Az élő szervezetben a fehérjék poszt-transzlációs módosulásai jelentős szerepet töltenek be, melyek közül egyik leggyakoribb a glikoziláció. A proteomikai kutatásokat kiegészítve a szénhidrátok (N-glikánok és glükózaminoglikánok) tömegspektrometrián alapuló vizsgálata is rendkívül fontos, bár kevésbé triviális. Biológiai minták glikomikai analízise során az elsődleges probléma a minta nagy komplexitása, a korlátozott mintamennyiség, és a proteinekhez viszonyított alacsony relatív mennyiség. Ezek csökkentésére a mintákat tisztítani, és dúsítani kell. Ezek a mintaelőkészítési lépések jellemzően kromatográfiás eljárások.
A kutatás hosszú távú célja különböző vegyületcsaládok biokémiai szerepének, jelentőségének felderítése, egyes betegségeket jelző biomarkerek kidolgozása elsősorban daganatos megbetegedések esetében. A daganatos megbetegedések a fejlett világban a vezető halálokok közé tartoznak. A daganat kialakulásához vezető rendellenességek molekuláris szinten történő felfedezése nélkülözhetetlen a kezelés és diagnózis új stratégiáinak kidolgozása szempontjából.
A tervezett kutatás tehát három fő pilléren alapul: 1) glikánok szerkezetvizsgálata és analitikája, 2) ezek integrálása a proteomikával, 3) biológiai minták, mint például szövetmetszetek/szöveti mikroarray-ek (TMA)/extracelluláris vezikulumok molekuláris szintű vizsgálata. A különböző „omikai” területen elért eredmények integrálása fontos új kutatási irányzat, a „systems biology” része. A kutatás során nemcsak az eredmények összefésülése fontos, hanem a vizsgálatukra szolgáló módszerek összhangba hozása is.
Jelentkezési határidő: 2021-10-18
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
