témavezető: Nagy Szabolcs
társ-témavezető: Orbán László
helyszín (magyar oldal): Keszthely helyszín rövidítés: KE
A kutatási téma leírása:
Célunk a halak fiziológiájának vizsgálata elsősorban a molekuláris biológia, genomika és citomika eszközeivel, különös tekintettel a szaporodásbiológiára, a stresszérzékenységre és a fertőző betegségek halakra gyakorolt hatásaira. Kísérleteinket elsősorban a zebradánió modell fajon fogjuk megvalósítani, de terveink között szerepel több, az akvakultúra számára kiemelten fontos haszonhal faj, így pl. a lesőharcsa és a ponty analízise is. Az ‘in vivo’ vizsgálatok mellett tervezünk ‘in vitro’ és ‘ex vivo’ megközelítéseket is.
A genomikai vizsgálatok legfőbb eszköze elsősorban a célszervek transzkriptómájának analízise lesz második - sőt esetleg harmadik - generációs, nagyléptékű szekvenálási eljárásokkal. A kapott eredményeket RT-qPCR eljárással fogjuk validálni. Terveink között szerepel a halak mikrobiómájának genomikai analízise is.
A citomikai vizsgálatok elsősorban hematológiai paraméterekre koncentrálnak (heterofil granulocita/limfocita arány, mint stresszparaméter, fehérvérsejt-fenotipizálás), de emellett újgenerációs citometriai eszközökkel kívánjuk vizsgálni a különböző kezeléseknek kitett csoportok bélmikrobioma-változásait, a drágább és időigényesebb standard genomikai megközelítés gyors alternatívájaként. Emellett a szekvenálási munkák előkészítéseként flow citométeres genomméret-analíziseket tervezünk.
A kísérleti tervben tudatosan törekedni fogunk arra, hogy az citomikai és genomikai megközelítések a fent leírtak szerint erősítsék egymást. A két laborban a téma személyi és tárgyi feltételei, illetve azok anyagi fedezete rendelkezésre állnak.
Reményeink szerint a tervezett kísérletekből nyert adatok segítségével lehetőségünk nyílhat a halak alap- és alkalmazott kutatásában felmerülő fontos kérdések megválaszolására.
ajánlott nyelvtudás (magyar oldal): angol felvehető hallgatók száma: 1
Jelentkezési határidő: 2021-05-31
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
