Bejelentkezés
 Fórum
 
 
Témakiírás
 
Bioinformatikai fejlesztés újgenerációs szekvenálási adatok kiértékeléséhez

TÉMAKIÍRÁS

Intézmény: Szegedi Tudományegyetem
biológiai tudományok
Biológia Doktori Iskola

témavezető: Haracska Lajos
helyszín (magyar oldal): ELKH, Szegedi Biológiai Kutatóközpont
helyszín rövidítés: SZBK


A kutatási téma leírása:

A biológiai kutatások egyik legrohamosabban fejlődő területe az újgenerációs szekvenálási eljárások (NGS). Ezek az eljárások képesek költséghatékony módon jelentős mennyiségű genomikai adat előállítására. Bár az általános bioniformatikai módszerek már lefektetésre kerültek, azonban ezek adaptálása a különböző mintaelőkészítési eljárásokhoz további és új fejlesztéseket igényel. Ilyen például az egyedi molekuláris számlálók használatának bevezetése, amellyel a mintaelőkészítés során minden eredeti DNS darab egy teljesen egyedi számlálóval kerül kapcsolatba, így a későbbiekben ezek pontos azonosításával az eredeti templátmennyiség, függetlenül a későbbi amplifikációs lépésektől, pontosan számolhatóvá válik, és segítségükkel csökkenthetők a könyvtárkészítés során fellépő hibák. A meghirdetett téma során lehetőség nyílik fejlesztések bevezetésére és kidolgozására minden jelenleg NGS-sel vizsgált módszerrel kapcsolatban (ChIP-Seq, RNA seq, Metagenom, egysejt technikák).

előírt nyelvtudás: angol
ajánlott nyelvtudás (magyar oldal): angol
további elvárások: 
4,0 feletti tanulmányi átlag, TDK-n vagy egyéb tanulmányi versenyen történő indulás, laboratóriumi tapasztalat.

felvehető hallgatók száma: 5

Jelentkezési határidő: 2021-09-01


2024. IV. 17.
ODT ülés
Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).

 
Minden jog fenntartva © 2007, Országos Doktori Tanács - a doktori adatbázis nyilvántartási száma az adatvédelmi biztosnál: 02003/0001. Program verzió: 2.2358 ( 2017. X. 31. )