témavezető: Batta Gyula
helyszín (magyar oldal): Kémia épület, mélyföldszint, alsó földszint, E-18 (dolgozó szoba) helyszín rövidítés: KÉMIA
A kutatási téma leírása:
Négy homológ (AFP, NFAP, NFAP2, PAFB,) béta-redős szerkezetű (50-60 aa), ám eltérő hatásmechanizmusú antifungális fehérje atomi felbontású szerkezetének meghatározása van folyamatban. Fehérje laboratóriumunkban jó hozammal állítunk elő NMR vizsgálatokra alkalmas 15N és/vagy 13C izotóppal jelölt fehérjéket és azok variánsait a Penicillium chrysogenum dPAF génkiütött mutánsával. Az NMR jelhozzárendelést követően, a spektrumok elemzésével, a fehérjék oldatfázisú térszerkezete és belső mozgásaik meghatározhatók. Speciális NMR módszerekkel (pl. telítés-átvitel, NOE) vizsgáljuk az Aspergillus nidulans és az A. niger fonalas gombákból származó membrán-kivonatok és az antifungális fehérjék interakcióit. NMR és ITC/DSC (izotermális titrációs/ differenciális szkennelő mikrokalorimetria) módszerekkel tanulmányozzuk a membránalkotó kis-molekulák (foszfatidil-inozitolok, ergoszterol, kationok: Ca2+, Zn2+) interakcióit fehérjéinkkel , míg a feltételezett membránfehérje partnerek azonosítása speciális elválasztástechnikát igényel. A fehérjék feltekeredési folyamatának és gerjesztett állapotainak vizsgálatára hőmérsékleti és kémiai stresszt alkalmazunk, ami lehetőséget ad a jelenségek termodinamikájának értelmezésére.
Irodalom:
1. Sonderegger, et.al. PLOS ONE, Paper e0169920. 21 p. (2017)
2. Fizil Á, Gáspári Z, Batta Gy: Egy gombaellenes gombafehérje. PAF, a bűvös hatóanyag TERMÉSZET VILÁGA 148:(6) pp. 265-268. (2017)
3. Sonderegger, et.al. MICROBIAL CELL FACTORIES 15: Paper 192. 14 p. (2016)
4. Fizil et.al. CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL 21:(13) pp. 5136-5144. (2015)
5.Kövér KE, Batta Gy: NMR investigation of disulfide containing peptides and proteins in Royal Society of Chemistry Publishing, 2014. pp. 37-59. (Specialist Periodical Reports - Amino Acids, Peptides And Proteins, ISSN:1361-5904; Volume 38., ISBN:978-1-84973-585-8
felvehető hallgatók száma: 2
Jelentkezési határidő: 2018-04-01,
Prof. Dr. Batta Gyula, batta@unideb.hu
felvehető hallgatók száma: 1
Jelentkezési határidő: 2020-11-15
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
