témavezető: Molnár Mária Judit
helyszín (magyar oldal): Semmelweis Egyetem, Genomikai Medicina és Ritka Betegségek Intézete helyszín rövidítés: SE
A kutatási téma leírása:
A neurodegeneráció mind a primer, mind a szekunder mitochondriális diszfunkcióval szoros összefüggését számos irodalmi adat támasztja alá. Ennek ellenére a neurodegenerativ betegségek kezelése a mai napig megoldatlan. A betegségcsoport pathomechanizmusának jobb megértése kutatásunk általános célja.
Jelen kutatási téma specifikus céljai:
• a neurodegenerációra hajlamosító ritka genetikai variánsok hatásának funkcionális elemzése,
• a mitochondriális DNS (mtDNS) „maintenance” zavarok és a mitochondrium és az mtDNS neuroinflammáció iniciálásában játszott szerepének vizsgálata
• a fenti folyamatokat befolyásoló farmakológiai beavatkozások, és életmód javaslatok „proof of concept” összeállítása.
A fenti célok megvalósításához a következő feladatok megvalósítása szükséges:
1. Teljes exom és teljes genom vizsgálatok, valamint és új neurodegenerativ betegségekkel asszociációt mutató gének ritka variánsainak, az immunogének gyakori variánsainak azonosítása
• Neurodegenerativ betegségben szenvedő egyének teljes exom adatainak elemzése. Az elemzés génprioritizálása elsősorban, de nem kizárólagosan a mitochondriális és a neuroinflammációs útvonalakra, génhálózatokra fókuszál, a ritka variánsok mellett az immungének gyakori elemzésére is kiterjed. Az immungének vizsgálatát ImmunArray-vel is tervezzük kiterjeszteni.
2.Az azonosított, kiemelt jelentőségű ritka genetikai variánsok funkcionális hatásának vizsgálata:
• Transzkriptom analízis a vizsgált mutációkat hordozó stabil sejtvonalakon és az siRNS csendesített mintákon.
• Gén exressziós változások validálása real-time PCR-el, protein expresszió vizsgálata Western blottal.
• Immuncitokémiával ko-lokalizációs vizsgálatok
• Bioenergetikai mérések: a stabil sejtvonalakon és a siRNS csendesített mintákon
3.dNTP pool rendellenességek vizsgálata és a dNTP pool befolyásolására proof of concept vizsgálatok végzése
• Az 1.pontban azonosított elsődleges intergenomiális kommunikációs zavarok (primer mitochondriális betegségek) valamint másodlagos dNTP pool eltérések (öregedés, neurodegeneráció) modelljeinek jellemzése, ezen folyamatok farmakológiai (pl. folate 1- carbon folyamatokra ható molekulák, nucleosidok) befolyásolhatóságának vizsgálata in vitro modellekben a különböző kórképekben szenvedő páciensek primer sejtjein és stabil sejtvonalakon, esetleg iPS sejteken.
• Aerobic jellegű tréning (proof of concept vizsgálat) primer mtDNS betegségben és igazoltan szekunder mtDNS károsodással biró neurodegenerativ betegségben szenvedőkben.
4. Mitochondriális epigenetikai hatások vizsgálata neurodegenerációban és az öregedés folyamataiban
Multifaktoriális AD, PD, ALS betegek, valamint a primer mtDNS betegek és egészséges idős egyének, egészséges ikrek egy sejtre vetített
● átlagos mtDNS kópiaszámának és telomerase hosszának vizsgálata,
● epigenetikai faktorok (metiláció, miRNS-ek vizsgálata).
● a metilációs mintázat és a SAM (S-adenylmethionin), mint egy 1-carbon metabolizmus termék kapcsolatának vizsgálata
● kapcsolat keresése az mtDNS „maintenance” betegségekkel
Jelentkezési határidő: 2020-09-01
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
