Számos mikroorganizmus képes a nikotinsav (NS) nitrogénforrásként történő hasznosítására, azonban eddig csak a prokarióták katabolikus útvonalait tanulmányozták. Ez a kutatási terület igen népszerű, mivel az útvonalban azonosított enzimek heterociklusos prekurzorok biokonverziójára használhatóak, amivel biológiai aktív hatóanyagokat és előanyagokat állítanak elő a gyógyszeripar és az agráripar számára. Ennek tükrében indokolt az eukarióta NS katabolikus útvonalak megismerése, ami ezidáig nem történt meg. Az első NS katabolikus útvonal feltárása 4 évvel ezelőtt kezdődött a laborunkban. Felfedtük az útvonal regulációját és genetikai hátterét, amely során jellemeztünk 6 klaszterbe rendeződő gént (hxnR/P/S/T/Y/Z) és génterméket, illetve valószínűsítettünk további klaszterekbe rendeződve 3 (hxnX/W/V) illetve 2 gént (hxnM/N). A HxnS a NS-at 6-hidroxinikotinsavvá (6NS) alakítja, valamint egy még nem azonosított hidroxilációs termékké (NHT). A 6NS-at a HxnY és HxnT enzimek alakítják tovább, a NHT-et pedig vagy maga a HxnS, vagy pedig valamelyik újonnan azonosított klaszter-gén. A HxnP és HxnZ útvonalspecifikus transzporterek. A továbbiakban a NS katabolikus útvonal teljes feltárását tervezzük a második és a harmadik klaszter génjeinek (hxnX/W/V és hxnM/N) funkcionális vizsgálatával, gén-deléciós törzsek létrehozásán és vizsgálatán keresztül. Tervezzük az útvonal-metabolitok azonosítását GC-MS analízissel a deléciós törzsek felhasználásával, valamint az első klaszter tanulmányozása során felmerült biológiai kérdések közül a HxnS evolúciójának kísérletes rekonstruálását, és a HxnR nukleáris szublokalizációját és hatásmód vizsgálatát.
Ámon J, Fernandez-Martin R, Bokor E, Cultrone A, Kelly JM, Flipphi M, Scazzocchio C and Hamari Z. (2017) A eukaryotic nicotinate-inducible gene cluster: convergent evolution in fungi and bacteria. Open Biol. 2017 Dec;7(12). pii: 170199. doi: 10.1098/rsob.170199. PMID: 29212709.
előírt nyelvtudás: angol további elvárások: szakmai elkötelezettség, alapvető gyakorlati jártasság a mikrobiológia és molekuláris biológia területén
felvehető hallgatók száma: 1
Jelentkezési határidő: 2019-12-31
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
