témavezető: Szabados László
helyszín (magyar oldal): MTA Szegedi Biológiai Központ, Növénybiológiai Intézet, Szeged helyszín rövidítés: SzBK
A kutatási téma leírása:
A magasabbrendű növényekben a prolin koncentráció növekedése egy tipikus élettani válasz a szárazság és só stress során. A prolin felhalmozódást a bioszintézist meghatározó P5CS1 és P5CS2 illetve a degradációt szabályozó PDH1 és PDH2 gének szabályozzák, amelyeket az abszcizinsav (ABA) indukál illetve gátol. Újabb adataink szerint a prolin felhalmozódást illetve a P5CS1 indukciót valamint a PDH1 gátlást más környezeti faktorok, például a fény és a foszfát hiány is befolyásolja. A fény jelátvitel egyik központi eleme a HY5 transzkripciós faktor, ami előzetes eredményeink szerint a P5CS1 gének promoteréhez is kötődik. A projektünk célja a prolin anyagcserét meghatározó stressz, fény és hormonális szabályozó folyamatok molekuláris szintű kölcsönhatásainak jellemzése, jobb megismerése. ChIP és EMSA technikákkal vizsgáljuk a HY5 és más fény és ABA szabályozásban résztvevő faktorok P5CS1 és a PDH1 promoterekhez való kapcsolódását. Egy új promoter jellemzési stratégiát követve CRISPR/Cas9 génszerkesztési eljárást alkalmazva változtatjuk meg a P5CS1 promoter cisz szabályozó szekvencia elemeit. Immunoprecipitációs vagy BiFC módszerrel tanulmányozott faktorok kölcsönhatásait. A szabályozó gének biológiai funkcióját inszerciós mutánsok segítségével jellemezzük. A mutánsokat komplex fenotipizálásos platform segítségével, élettani és metabolomikai módszerekkel is vizsgáljuk. A kutatási programunk segítségével jobban megismerjük a fényszabályozás valamint a stresszválasz közötti kapcsolatokat, a prolin metabolizmust ellenőrző jelátviteli utak kölcsönhatásait és várhatóan jobban megértjük a stress tolerancia molekuláris alapjait.
előírt nyelvtudás: angol további elvárások: Érdeklődés a tudományos kutatások iránt, kreativitás. Alapfokú jártasság molekuláris biológia, genetika, biokémia, bioinformatika területén.
felvehető hallgatók száma: 1
Jelentkezési határidő: 2019-12-31
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).