Bejelentkezés
 Fórum
 
 
Témakiírás
 
Barta Csaba
A Tourette szindróma genetikai és epigenetikai rizikófaktorainak vizsgálata

TÉMAKIÍRÁS

Intézmény: Semmelweis Egyetem
elméleti orvostudományok
Molekuláris orvostudományok Doktori Iskola

témavezető: Barta Csaba
helyszín (magyar oldal): Semmelweis Egyetem Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Pathobiokémiai Intézet
helyszín rövidítés: SE


A kutatási téma leírása:

A Tourette szindrómával összefüggésbe hozható gének és régiók mikroRNS-ek általi szabályozásának vizsgálata, valamint a szabályozás funkcionális karakterizálása.

2.
A kandidáns gének epigenetikai vizsgálata kezelt és kezeletlen neurális sejtvonalakban.

3.
A teljes genomra kiterjedő DNS metiláció változásának vizsgálata kezelt és kezeletlen állatmodellekből származó agymintákban, valamint humán vérmintákban. (A vizsgálatokhoz a következő módszerek kerülnek alkalmazásra: promoter vagy CpG sziget-specifikus microarray, MeDIP szekvenálás, immunfluoreszcens technikák, biszulfitos genom szekvenálás.)

A kutatás leírása:

A szövetspecifikus génexpresszió szabályozásában számos molekuláris mechanizmus vesz részt, beleértve az epigenetikai módosításokat, illetve a nem kódoló RNS-eket (különös tekintettel a mikroRNS-ekre), melyek a betegség patogenezisét befolyásolják. A kandidáns mikroRNS-ek hatását az in silico módszerekkel meghatározott célgénekre, illetve az gének szabályozó régióiban fellelhető génvariánsok befolyását eme regulációra funkcionális vizsgálatokkal kívánjuk megerősíteni. Különböző humán neuronális sejtvonalakon (pl. neuroblastoma IMR32, SH-SY5Y és SK-NF1, valamint retinoblastoma Y79 sejteken) luciferáz riporter-génexpressziós analíziseket tervezünk, kiegészítve RT-PCR, illetve Western blot vizsgálatokkal. A kutatást finanszírozó EU-s Marie Curie projekt keretében egy német gyógyszergyári kollaborációban előállított rágcsáló Tourette modellállatok agymintáiban tervezzük a striatumban létrehozott 6-OH-dopamin lézió hatására létrejövő epigenetikai változások vizsgálatát. A tejes genom metilációt mikroarray technikával, illetve MeDIP szekvenálással vizsgáljuk, a targetek validálására biszulfitos szekvenálást alkalmazunk. A hisztonok módosításait kromatin immunprecipitációval (ChIP) vizsgáljuk. Az állatok léziót követő különböző glutamáterg és dopaminerg szerekkel való kezelését követően szintén vizsgáljuk az epigenetikai változásokat.


Jelentkezési határidő: 2019-11-05


2019. IX. 13.
ODT ülés
Az ODT következő ülésére 2019. október 11-én 12.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).

 
Minden jog fenntartva © 2007, Országos Doktori Tanács - a doktori adatbázis nyilvántartási száma az adatvédelmi biztosnál: 02003/0001. Program verzió: 2.2358 ( 2017. X. 31. )