témavezető: Hegedűs Tamás
helyszín (magyar oldal): MTA helyszín rövidítés: MTA
A kutatási téma leírása:
Transzmembrán (TM) fehérjék rendezetlen régióinak (IDR, intrinsically disordered region) kölcsönhatásai számos szabályozó folyamatban játszanak fontos szerepet, s ezek a kölcsönhatások nem csak fehérje partnerekkel, hanem a membrán kettősréteggel is kialakulhatnak. Ahhoz, hogy ezeket a kölcsönhatásokat patológiás folyamatokban módosítani tudjuk, atomi szinten kell ismernünk e membránkötő motívumokat (memMoRF, membrane Molecular Recognition Feature). Céljaink: (1) memMoRF-ok azonosítása és adatbázisba szervezése. (2) Amennyiben két hélix között helyezkedik el az IDR, konformációs terét limitálja és így konformációs sokaságát nagyban befolyásolhatja a sejtmembrán és a TM hélixek, ezért a jelenséget molekuladinamikai szimulációkkal vizsgáljuk. (3) Kísérletesen, elsősorban egyedi-molekula erőspektroszkópiai módszerek alkalmazásával, jellemezzük a klinikailag fontos CFTR fehérje rendezetlen régiójának membrán és fehérje kapcsolatait. Eredményeink hozzájárulnak rendezetlen fehérjék regulációs kölcsönhatásainak megértéséhez, és előmozdítják a cisztás fibrózisban, a tumorgenezisben és neurodegeneratív betegségekben szerepet játszó memMoRF-okat tartalmazó fehérjék modulálására irányuló törekvéseket.
előírt nyelvtudás: angol felvehető hallgatók száma: 1