Bejelentkezés
 Fórum
 
 
Témakiírás
 
Tantos Ágnes
Epigenetikai szabályozásban jelentős fehérje-lncRNS komplexek szerkezeti és funkcionális jellemzése

TÉMAKIÍRÁS

Intézmény: Eötvös Loránd Tudományegyetem
biológiai tudományok
Biológia Doktori Iskola

témavezető: Tantos Ágnes
helyszín (magyar oldal): MTA TTK Enzimológiai Intézet, Rendezetlen fehérjék kutatócsoport (1117 Bp. Magyar tudósok krt. 2.) / RCNS HAS Institute of Enzymology, Research Group of Disordered Proteins
helyszín rövidítés: MTA


A kutatási téma leírása:

A hiszton fehérjék poszttranszlációs módosítása (PTM) kiemelt szerepet játszik a génműködés szabályozásában. Az egyik legtöbbet tanulmányozott PTM a lizinek metilációja, melyet a hiszton lizin metiltranszferázok (HKMTk) katalizálnak. A HKMTk számos betegség kialakulásában érintettek, és működésüket intenzíven tanulmányozzák. Az utóbbi pár év tudományos felfedezései közé tartozik a hosszú nem-kódoló RNS-ek (lncRNS-ek) fehérje működésre kifejtett hatásainak felismerése. Az egyik prominens jelenség az lncRNS-ek hatásmechanizmusában, hogy különböző hiszton módosító fehérjék kötésével módosíthatják az epigenetikai mintázatot. Az egyik legismertebb ilyen kölcsönhatás a PRC2 (Polycomb Repressive Complex 2) lncRNS kötése. A PRC2 több alegysége (EZH2 és SUZ12) is képes többféle RNS kötésére, melynek kísérletekkel igazolt sejtélettani hatása van. Az egyik legfontosabb nyitott kérdés a területen jelenleg az, hogy hogyan egyeztethető össze bizonyos lncRNS-ek specifikus hatása a PRC2 látszólagosan nem-specifikus RNS-kötésével. Számos más HKMT által szabályozott folyamatban is leírták lncRNS-ek szerepét, ám ezek molekuláris hátteréről igen keveset tudunk. A HKMTk több hosszú rendezetlen szakasszal rendelkeznek, melyek funkciójáról elenyészőek az ismereteink, ám több olyan szekvenciális motívumot is tartalmaznak, melyek makromolekuláris interakciókért lehetnek felelősek. A kutatás célja, hogy a HKTMk rendezetlen régióinak szerepét feltérképezzük, különös tekintettel az lncRNS-ekkel kialakított kölcsönhatásokra. A vizsgált fehérjék közé tartozik az EZH2, melyről ismert, hogy egy rendezetlen loop régió felelős az RNS kötéséért, a SUZ12, és több olyan HKMT rendezetlen régió, melyek feltehetően RNS kötésre képesek.

előírt nyelvtudás: angol
további elvárások: 
általános laboratóriumi tapsztalat szükséges, az RNS munka és/vagy a fehérje expresszió és tisztítás területén szerzett tapasztalat előnyt jelent

felvehető hallgatók száma: 3

Jelentkezési határidő: 2018-05-31


2024. IV. 17.
ODT ülés
Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).

 
Minden jog fenntartva © 2007, Országos Doktori Tanács - a doktori adatbázis nyilvántartási száma az adatvédelmi biztosnál: 02003/0001. Program verzió: 2.2358 ( 2017. X. 31. )