témavezető: Beke-Somfai Tamás
helyszín (magyar oldal): MTA Természettudományi Kutatóközpont helyszín rövidítés: MTA
A kutatási téma leírása:
A mikróbák által okozott fertőző betegségek globális méretű fenyegetést jelentenek. A baktériumok gyorsan növekedő ellenállásanak köszönhetően a jelenlegi antibiotikumok egyre kevéssé hatékonyak. Ezért kiemelten fontos olyan új vegyületek keresése és tervezése melyek a jövőben sikeresen pótolják a jelenlegi gyógyszereket. A természetben található toxikus oligomerek számos esetben hidrofil és hidrofób szerkezetekbe rendeződnek össze és úgy fejtik ki hatásukat. Ennek az önrendeződésnek a mechanizmusa azonban még nem feltárt, így a hasonló vegyületek tervezése akadályokba ütközik.
A fenti mechanizmus jobb megértéséhez nem természetes alapú (ún. Foldamer) peptidek tervezését és fejlesztését végezzük. Célünk a peptidek és a sejtfalakat képző lipid kettősrétegek kölcsönhatásának jobb megértése molekuláris szinten. Az így szerzett tapasztalatok jelentősen hozzájárulhatnak új antimikróbiális vegyületek tervezéséhez.
A tervezett szerkezeteket modern számítógépes eszközökkel (kvantummechanikai QM, és molekuladinamikai MD módszerekkel) építjük fel és vizsgáljuk, majd a szintetizált peptideket kísérleti módszerekkel vizsgáljuk, többek között polarizált fényspektroszkópiai és röntgen szórási módszerekkel.
A kutatási terv keretében a szintetikus munkát a Göteborgi (Svédország) kollaboráló partnerek végzik. A jelentkező hallgatók számára lehetőség adódik a téma keretében több rövid idejű kiutazással részt venni a partner labor feladataiban is.
Referenciák:
1. J. Johansson, E. Hermansson, N. Kann, B. Nordén, T. Beke-Somfai: -Peptides from RuAAC-Derived 1,5-Disubstituted Triazole Units, Eur. J. Org. Chem. 2014, 13, 2703-2713
2. N. Kann, J. R. Johansson, T. Beke-Somfai*: Conformational properties of 1,4- and 1,5-substituted 1,2,3-triazole amino acids – building units for peptidic foldamers, Organic & Biomolecular Chemistry, 2015, DOI: 10.1039/C4OB02359E
3. T. Beke, A. Czajlik, B. Bálint, A. Perczel: A Theoretical Comparison of Self-Assembling - and -Peptide Nanostructures: Toward Design of -Barrel Frameworks ACS Nano, 2008, 2, 545-553
4. T. Beke, I. G. Csizmadia, A. Perczel: Theoretical study on tertiary structural elements of -peptides: Nanotubes formed from parallel-sheet-derived assemblies of -peptides J. Am. Chem. Soc., 2006, 128, 5158-5167
felvehető hallgatók száma: 1
Jelentkezési határidő: 2018-05-31
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
