A növényi vírusok rendkívül változatos tüneteket és gyakran komoly gazdasági károkat okoznak, ezzel veszélyeztetve az élelmiszer ellátás biztonságát. Ennek ellenére mégis keveset tudunk a tüneteket okozó változások molekuláris mechanizmusairól. Kutatásunk fő célja, hogy először egy rendkívüli genetikai és genomikai eszköztárral rendelkező modellnövényben (Arabidopsis thaliana) tanulmányozzuk a tünetek kialakulásának molekuláris hátterét, és hogy azonosítsuk a vírustünetek enyhítéséért felelős növényi géneket. Kísérleteinkhez az Arabidopsis természetes földrajzi variánsait, ökotípusait használjuk, mert ezekben a genetikai különbségek az idők során a beltenyészetség miatt rögzültek. Ez különösen alkalmassá teszi őket az összehasonlító genetikai vizsgálatokra. A genetikai különbségek a vírustünetekben is megnyilvánulnak: eltérő ökotípusok eltérő erősségű tüneteket mutatnak egyazon vírussal való fertőzés után. Eddigi vizsgálataink során két olyan ökotípust találtunk, amelyek nagyon eltérően reagálnak a Tarlórépa Mozaik Vírussal (TuMV) és az Útifű Mozaik Vírussal (RMV) való fertőzés hatására. Hipotézisünk az, hogy az eltérő erősségű vírustüneteket mutató ökotípusokban a tünetek kifejeződésében szerepet játszó gének (mRNS, kis RNS) kifejeződésében is jelentős különbségek lesznek. Ezért a vírusokkal és üres kontrollal inokulált ökotípusokból RNS könyvtárakat fogunk készíteni genomszintű transzkriptom, kis RNSom és degradom szekvenáláshoz. Az mRNS és kisRNS expressziós profilokban megfigyelhető különbségek bioinformatikai elemzésével képesek leszünk azonosítani a vírustünetek enyhítéséért felelős növényi géneket.
előírt nyelvtudás: angol felvehető hallgatók száma: 1
Bejelentkezés
