témavezető: Deák Péter
helyszín (magyar oldal): Szegedi Tudományegyetem Genetika Tanszéke és a Szegedi Biológiai Kutatóközpont Biokémia Intézete helyszín rövidítés: SzTE
A kutatási téma leírása:
A fehérjék reverzibilis ubikvitilációja olyan alapvető sejtfolyamatok szabályozásában játszik szerepet, mint a sejtosztódás, sejtpusztulás, génkifejeződés és jelátvitel. Az ubikvitiláció egy dinamikus folyamat, amely során az ubikvitiláló enzimek kapcsolják az ubikvitin molekulákat a célfehérjékhez, amit aztán a dezubikvitiláló enzimek, vagy DUB-ok távolítanak el. Ma már nyilvánvaló a DUB enzimek jelentősége, és számos tanulmány foglalkozott a DUB-ok enzimatikus tulajdonságaival és hatásmechanizmusával, azonban tudásunk még mindig hiányos az élettani fontosságukat és a szabályozásukat illetően. Abból a célból, hogy kiderítsük élettani fontosságukat és, hogy alaposabb ismereteket szerezzünk a sejten belőli feladatukról és szabályozásukról, különböző DUB enzimeket kódoló gének mutánsainak szisztematikus genetikai vizsgálatát végezzük egy genetikailag jól kezelhető kísérleti rendszerben, az ecetmuslicában (Drosophila melanogaster). A téma iránt érdeklődő PhD hallgató feladata lesz, hogy genetikai interakción alapuló elsődleges szűréseket végezzen avval a céllal, hogy azonosítsuk azokat a DUB géneket, amelyeknek szerepe lehet a tumorgenezisben és a fehérjedegradációban. Ezt követően részletes funkcionális analízist végezzen néhány, a fenotípusos adatok alapján kiválasztott DUB génen. Mivel az ubikvitiláció és dezubikvitiláció is alapvető fontosságú a normál sejtosztódáshoz, e két folyamat nem megfelelő aktivációja, vagy inaktivációja hibás sejtosztódáshoz vezethet, ami akár rákot okozhat. Ezt a feltételezést igazolja, hogy egy-egy DUB hibás szabályozása már összekapcsolható volt daganatképződéssel. Azt reméljük, hogy az általunk elvégzett vizsgálatok nemcsak a DUB-ok funkciójával és szabályozásával kapcsolatosan bővítik majd ismereteinket, hanem lehetőséget teremtenek arra is, hogy manipulálhassuk a DUB-ok aktivitását, amivel akár új terápiás lehetőség is nyílhatnak a rák elleni küzdelemben.
előírt nyelvtudás: angol további elvárások: Biztos genetikai és molekuláris biológiai alapismeretek.