témavezető: Kövér Katalin
helyszín (magyar oldal): DE TTK Szervetlen és Analitikai Kémai Tanszék helyszín rövidítés: E-19
A kutatási téma leírása:
Biológiailag aktív szénhidrátok, peptidek és származékaik, valamint egyéb természetes illetve szintetikus eredetű molekulák (pl. két-/három-kötéses interglikozidos híddal kapcsolódó oligoszacharidok, heparin-analóg pentaszacharidok, peptid toxinok, poliol-származékok) oldatbeli szerkezetének, mozgási jellemzőinek és fehérjékkel (pl. lektinek, protein foszfatázok, antitrombin) való kölcsönhatásainak vizsgálatára korszerű 1D és 2D NMR spektroszkópiai módszereket alkalmazunk. A kölcsönhatás termodinamikai és kinetikai paramétereinek meghatározására ITC (izotermikus titrációs kalorimetria) és SPR (felületi plazmon rezonancia) vizsgálatokat tervezünk.
A molekuláris felismerésért felelős kölcsönhatások atomi szintű vizsgálatára, azaz a ligandum-fehérje komplexek szerkezetfelderítésére, a kötött állapotú ligandumok konformációjának meghatározására, a kölcsönhatásért felelős funkciós csoportok kimutatására telítés-átvitelen alapuló NMR technikákat (STD, tr-NOE) alkalmazunk ill. azokat szükség szerint továbbfejlesztjük. Az interglikozidos kötésben Se-t tartalmazó származékok esetében (diglikozol-monoszelenid, ill. diglikozil-diszelenid) gyors és hatékony 77Se NMR-en alapuló módszereket tervezünk kidolgozni a lektin-kötődés vizsgálatára. A 15N-jelölt lektinek lehetőséget adnak a fehérje szénhidrát-kötőhelyének feltérképezésére.
előírt nyelvtudás: angol további elvárások: számítógépes ismeretek