Bejelentkezés
 Fórum
 
 
Témakiírás
 
Kövér Katalin
Peptid modellek és peptid-fehérje kölcsönhatás vizsgálata NMR-spektroszkópiával és számítógépes molekulamodellezéssel

TÉMAKIÍRÁS

Intézmény: Debreceni Egyetem
kémiai tudományok
Kémia Doktori Iskola

témavezető: Kövér Katalin
helyszín (magyar oldal): DE TTK Szervetlen és Analitikai Kémai Tanszék Kémia épület E-19, NMR laboratórium
helyszín rövidítés: E19


A kutatási téma leírása:

A kutatás célja különböző biológiai funkcióval rendelkező modell peptidek/fehérjék szerkezetének, dinamikájának jellemzése és kölcsönhatásainak vizsgálata NMR-spektroszkópiai módszerekkel és elméleti számításokkal.
Vizsgálni tervezett rendszerek:
(1) fotolitikus hasításra érzékeny, diszulfid-hidat tartalmazó fehérjék peptid modelljeinek részletes szerkezetvizsgálata NMR, CD és molekuladinamika számítások kombinált alkalmazásával a fotolitikus redukció szerkezeti/dinamikai aspektusainak megismerése céljából.
(2) a sejtdifferenciáció szabályozásában szerepet játszó, in silico tervezett peptid/fehérje modellek szerkezet-dinamika-kölcsönhatás/biológiai funkció kapcsolatának vizsgálata.
A molekuláris felismerésért felelős kölcsönhatások atomi szintű vizsgálatára, a peptid-fehérje komplexek szerkezetének felderítésére, a kölcsönhatásért felelős funkciós csoportok kimutatására, a kötőhely feltérképezésére, a kölcsönhatás dinamikai jellemzőinek meghatározására ligandum- illetve fehérje-detektáláson alapuló NMR technikákat alkalmazunk, illetve azokat szükség szerint továbbfejlesztjük. 15N-jelölt peptid/fehérjevariánsok NMR relaxációs paramétereinek mérése révén vizsgáljuk a dinamika hatását a sejtdifferenciáció folyamatára. A dinamika és a biológiai hatás közti összefüggés elemzése lehetővé teszi a sejtdifferenciációnak peptid-analógokkal történő szabályozását, és ezáltal potenciális gyógyhatású készítmények kifejlesztését.

előírt nyelvtudás: angol
további elvárások: 
számítógépes ismeretek


Jelentkezési határidő: 2018-05-15


2024. IV. 17.
ODT ülés
Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).

 
Minden jog fenntartva © 2007, Országos Doktori Tanács - a doktori adatbázis nyilvántartási száma az adatvédelmi biztosnál: 02003/0001. Program verzió: 2.2358 ( 2017. X. 31. )