témavezető: Kiss Attila
helyszín (magyar oldal): Eötvös Loránd Tudományegyetem, Informatikai Kar helyszín rövidítés: ELTE
A kutatási téma leírása:
Watson és Crick már több mint ötven éve fedezte fel a DNS kettős spirálját. Ez egy új korszak kezdetét jelentette a molekuláris biológiában. Azóta nagyon sokat megtudtunk a biológiai struktúrákról, biológiai folyamatokról. Az elért eredmények nagy része elképzelhetetlen lett volna számítógépek használata nélkül. A számítástudomány és újabban az adattudomány vezető szerepet játszik a bioinformatikában. Manapság az a feladat, hogy összegyűjtsük, elemezzük, hasznosítsuk a biológiai adatokat. Mindehhez felhasználjuk a klasszikus sztring algoritmusokat, a DNS szekvenciák elemzését, az adatbázis-kezelés alapjait, és számos új informatikai területet is.
Ugyanakkor rohamosan nő az igény a bioinformatika matematikai vonatkozásai, formalizálások, elemzések iránt is. A matematika eszköztára jól használható az összetett biológiai struktúrák, minták, folyamatok leírására. A matematikai eszközök segítségével becsléseket lehet adni, mintákat, trendeket kimutatni, biológiai összefüggéseket, kapcsolatokat lehet feltárni.
A hallgató feladata új bioinformatikai algoritmusok kidolgozása, vagy a már meglévő algoritmikus eszköztárak javítása, fejlesztése, a kidolgozott algoritmusok elemzése algoritmikus és matematikai szempontból, szükség esetén biológiai, genetikai adatbázis készítése, hatékony technológiák felhasználásával.
Ajánlott irodalom:
Hans-Joachim Böckenhauer and Dirk Bongartz. 2007. Algorithmic Aspects of Bioinformatics (Natural Computing Series). Springer-Verlag New York, Inc., Secaucus, NJ, USA.
He, Matthew, and Sergey Petoukhov. Mathematics of Bioinformatics: Theory, Methods and Applications. Vol. 19. John Wiley & Sons, 2011.
előírt nyelvtudás: Angol vagy magyar ajánlott nyelvtudás (magyar oldal): Angol további elvárások: Biológiai témák iránti érdeklődés, algoritmusok kódolása Python, C++ vagy más programozási nyelven, elemi adatbázis-kezelési ismeretek, valószínűségszámítási és statisztikai ismeretek.
felvehető hallgatók száma: 3
Jelentkezési határidő: 2018-05-31
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
