témavezető: Horváth Péter
helyszín (magyar oldal): Szegedi Biológiai Kutatóközpont helyszín rövidítés: SzBK
A kutatási téma leírása:
A szövetben található sejtek komplexitásának megértése lehet az egyik kulcs különböző betegségek sikeres kezeléséhez és biológiali kérdések megválaszolásához (Horvath, 2016, Nature Drug Disc., 15, 751). A rendszermikroszkópiában és rendszerbiológiában utóbbi időben végbement robbanásszerű fejlődés lehetővé teszi a képek automatikus és objektiv kiértékelését akár sok milliónyi kép és milliárd sejt esetében is (Badertscher, 2016, Cell Reports, 13, 12, 2879). Talán az egyik legnagyobb kihivást ezen a területen a sejtes mikrokörnyezet egysejtre gyakorolt hatása jelenti. Jelen project célja egy olyan rendszer fejlesztése mely első lépésben képek digitális korrekcióját végzi (Smith, 2015, Nature Methods, 12, 404), majd egy olyan jellemzőkinyerési algoritmus fejlesztése mely az egysejt jellemzőin felül a szomszédos sejtek, illetve a project második felében a szomszédos mikrokörnyezet nagyobb strukturális jellemzőit is figyelembe véve egy gépi tanuló algoritmust felhasználva a jelenleginél sokkal pontosabb és teljesebb képet ad szövetek egysejt alapú elemzés során.
előírt nyelvtudás: angol kommunikációs szinten ajánlott nyelvtudás (magyar oldal): angol anyanyelvi szinten felvehető hallgatók száma: 1