témavezető: Varga Zoltán
helyszín (magyar oldal): DE ÁOK Biofizikai és Sejtbiológiai Intézet helyszín rövidítés: DEBSI
A kutatási téma leírása:
A feszültség-függő ioncsatornák érzékelik a membránpotenciál változásait, és számos sejtfunkciót szabályoznak, mint pl. az ingerelhetőség vagy proliferáció. E csatornák hibás működése életveszélyes betegségekhez vezethet, és számos gyógyszermolekula célpontjaként szolgának. A csatornafehérje molekuláris szerkezetének ismerete nélkülözhetetlen a kapuzási mechanizmus és az azt befolyásoló külső faktorok hatásának megértéséhez. A szerkezet és a funkció átfogó szemlélete szükséges az ioncsatorna betegségek patomechanizmusának felfedéséhez, és a gyógyszerek szerkezet-alapú tervezéséhez. A feszültség-függő Kv10.1 K+ csatornát a tumorok és metasztázisok többsége kifejezi, de egészséges egyénekben csak az agyban található, s így kiváló potenciális gyógyszercélpontot jelent. E csatorna krio-EM szerkezete az ismert Kv csatornáktól jelentősen eltérő elemeket mutat, ami a működésre vonatkozó, kísérletesen ellenőrizhető hipotéziseket kínál. Felépítése hasonló az ismert Kv csatornákhoz, de a feszültség-érzékelő és pórus domének egymáshoz viszonyított elhelyezkedése merőben eltérő, és más Kv csatornákra nem jellemző doméneket is tartalmaz. A szerkezet alapján több, a funkcióra vonatkozó hipotézis született: a csatorna alacsony konduktanciájának, a pórus-blokkoló toxinok hiányának és a kalmodulin által okozott gátlás mechanizmusának magyarázatára, valamint az intracelluláris aktivációs kapu helyére vonatkozóan. A projektben a szerkezetre alapozott hipotéziseket fogunk kísérletesen tesztelni. Patch-clamp mérésekkel, feszültség-zár fluorometriával és metántioszulfonát reagensekkel végrehajtott cisztein-hozzáférési esszékkel vizsgáljuk a csatorna konformáció változásait a kapuzás során. Célunk, hogy kiegészítsük a szerkezetet a kapuzási mechanizmus részletes modelljével, hogy a Kv10.1 élettani szerepét jobban megérthessük, és használható adatokat nyújtsunk a szerkezet-alapú gyógyszertervezéshez.
előírt nyelvtudás: angol középfok felvehető hallgatók száma: 1
Jelentkezési határidő: 2018-02-18
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Bejelentkezés
