témavezető: Szittya György
helyszín (magyar oldal): MATE-GBI Növénybiotechnológia tanszék, 2100 Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4. helyszín rövidítés: MATE
A kutatási téma leírása:
Az epigenetikai módosításoknak (pl. hiszton kód, DNS-metiláció) fontos szerepe van a növényfejlődés szabályozásában azáltal, hogy meghatározzák és fenntartják a sejttípus-specifikus génexpressziós mintázatot. A hiszton módosítások közül az acetilálás/deacetilálás fontos szereppel bír a transzkripció szabályozásában. A doktori képzés alatt a PhD hallgató azt fogja vizsgálni, hogy az epigenetikai változásoknak milyen szerepe van a paradicsom levél és a levélszőr fejlődésére. Korábban SlIDM1 hiszton-acetiltranszferáz mutáns paradicsomvonalakat állítottunk elő és megfigyeltük, hogy ezek a növények levele magasabb ambiens hőmérsékleten a vad típustól eltérően fejlődik, illetve ezek a növények több fedőszőrrel és mirigyszőrrel rendelkeznek mind a szárukon, mind a levelükön, mint vad típusú társaik. Az SlIDM1 gén az Arabidopsis AtIDM1 gén paradicsom ortológja. Az AtIDM1 a „mester regulátora” az Arabidopsis AtROS1 által közvetített genom szintű DNS citozin demetilációnak. Mivel a paradicsom SlIDM1 az Arabidopsis AtIDM1 ortológja, és a hiszton acetiláció általában a génaktivációhoz kapcsolódik, előzetes eredményeink alapján feltételezzük, hogy az SlIDM1 szabályozza a levél és levélszőr fejlődésért felelős gének expresszióját azáltal, hogy megakadályozza azok hipermetilációját. A doktori munka során az SlIDM1 által szabályozott, levél és levélszőr fejlődésért felelős géneket szeretnénk genomszinten azonosítani. Tervezzük továbbá az SlIDM1 fehérje időbeli és térbeli expressziós mintázatának vizsgálatát a növény fejlődése során.
előírt nyelvtudás: angol további elvárások: 1 év molekuláris biológiai gyakorlat
angol középfokú nyelvvizsga