témavezető: Kintses Bálint
helyszín (magyar oldal): Szegedi Biológiai Kutatóközpont helyszín rövidítés: SZBK
A kutatási téma leírása:
A klinikumban egyre jelentősebb antibiotikumrezisztencia problémája főként arra vezethető vissza, hogy az antibiotikumrezisztencia-gének (ARG-k) átadódnak a környezetből a klinikailag releváns kórokozó baktériumokba. Így az, hogy az adott új antibiotikum milyen gyorsan szembesül az antibiotikumrezisztens kórokozókkal, nagyban függ attól, hogy mennyire elterjedtek a környezetben a rezisztencia gének, illetve hogy ezek a gének milyen könnyen juthatnak át a célbaktériumba, ezáltal potenciálisan hatástalanítva a kérdéses antibiotikumot. Ha azonban a nemrég piacra került, új antibiotikumokat vesszük figyelembe, tudásunk nagyon kezdetleges, arra nézve, hogy mely ARG lesz aktív ezekkel az antibiotikumokkal szemben. A fő probléma pedig az, hogy ezek az ARG-k általában már csak akkor válnak ismertté a klinikumban, ha már széles körben elterjedtek a kórokozó baktériumok között.
A PhD hallgató egy új kutatási módszert fog alkalmazni (DEEPMINE), amely funkcionálisan aktív ARG-ket azonosít. Az előbbiek alátámasztása érdekében a One Health megközelítésben résztvevő környezetek különféle mintáit alkalmazzuk, amely környezetek valószínűsíthetően nagy mennyiségű ARG-t tartalmazhatnak a jelenleg fejlesztés alatt álló, potenciálisan a jövőben klinikumban alkalmazható antibiotikumokkal szemben. A munkafolyamat lehetővé teszi, hogy feltérképezzük a legnagyobb rizikófaktorokat és terjedési útvonalakat az antibiotikumrezisztencia kialakulását illetően. A végső cél pedig az, hogy informáljuk az egész világot felölelő genomi felügyeleti programokat arról, hogy hogyan ismerhető fel és követhető jobban nyomon az antibiotikumrezisztencia terjedése.
előírt nyelvtudás: angol középfok további elvárások: releváns molekuláris és mikrobiológiai jártasság