témavezető: Szikora Szilárd
társ-témavezető: Mihály József
helyszín (magyar oldal): Szegedi Biológiai Kutatóközpont, Genetikai Intézet helyszín rövidítés: SzBK
A kutatási téma leírása:
Az aktin alapú vékony filamentumok meghatározott hossza kritikus a megfelelő izomműködéshez és a szabályozásának hibája különféle miopátiák kialakulásához vezet. Bár az aktin filamentumok képesek spontán összeszerelődni in vitro, azonban in vivo ez egy szabályozott folyamat, amely számos fehérje közreműködését igényli. A nem izomsejtekben a folyamat sok részlete feltárt, azonban a vékony filamentum összeszerelődés és elongáció molekuláris alapjai kevéssé ismertek. Annak érdekében, hogy jobban megértsük ezeket a folyamatokat, jellemezni fogjuk a vékony filamentumok dinamikáját a fejlődő izomban és elvégezzük a miofibrilláris aktin monomer pool kvantitatív jellemzését. A funkcionális elemzés kiemelkedő fontosságú része a résztvevő faktorok lokalizációs vizsgálata. Ennek érdekében kifejlesztettünk egy egyedi molekula lokalizáción alapuló mikroszkópos mérési módszert, amellyel a szarkomerikus fehérjék lokalizációja ~5-10 nanométer precizitással meghatározható, lehetővé téve a molekuláris szintű rekonstrukciót. Bár néhány aktin összeszerelő és szabályozó faktor már ismert a szarkomerekben, azonban a közelmúltban végzett átfogó RNS szekvenálás feltárta, hogy számos további aktin szabályozó génnek fokozódik a kifejeződése a vékony filamentum növekedés során. Ezeknek a jelölteknek a tesztelésére egy célzott RNSi screent tervezünk, amely az izomfejlődés specifikus fázisaiban fogja vizsgálni a vékony filamentum növekedésben betöltött szerepüket.
előírt nyelvtudás: angol további elvárások: Drosophila genetikában és/vagy molekuláris biológiában és konfokális mikroszkópizálásban való jártasság előny.
felvehető hallgatók száma: 1
Jelentkezési határidő: 2022-12-31
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).