témavezető: Tőzsér József
helyszín (magyar oldal): Debreceni Egyetem helyszín rövidítés: DEÁOK
A kutatási téma leírása:
Számos retrotranszpozon- vagy retrovírus-eredetű eukarióta fehérje ismert, melyek közül néhány a virális Gag fehérjék homológjaként az evolúció során megőrződött, és funkcióját megtartva az emlős szervezetekben jelentős szerepet tölt be. A közelmúltban a neuronális Arc fehérje esetében igazolták, hogy képes vírus-szerű kapszid struktúra kialakítására, a neuronok által kibocsájtott extracelluláris vezikulák pedig az idegrendszer sejtjei közti kommunikációban játszanak fontos szerepet. A PEG10 fehérje többek között betegségek patomechanizmusában és a placenta-fejlődésében játszik jelentős szerepet. A PEG10 esetében is igazolták vírus-szerű részecskék kialakulását. Kutatásaink során az endogén retrovirális Gag-fehérjével homológ domént tartalmazó fehérjék (elsősorban az Arc és PEG10 fehérjéinek) vizsgálatait tervezzük. Célunk a vad típusú és mutáns fehérjék rekombináns expressziója baktériumokban illetve eukarióta sejtekben, a fehérjék tisztítása. Tervezzük az egyes fehérjék esetében az oligomerizációs és a vírus-szerű részecske-kialakítási képesség vizsgálatát, valamint a keletkező vezikulák karakterizálását. A vezikulák összetételéről és azok mutáció-indukálta változásairól proteomikai és transzkriptomikai analízisek segítségével nyerhetünk információt. A tervezett munka része a proteomikai analízisekkel nyert adatok elemzése és a szükséges bioinformatikai analízisek kivitelezése is.