témavezető: Horváth Péter
helyszín (magyar oldal): SZTE helyszín rövidítés: SZTE
A kutatási téma leírása:
A szövetben található sejtek komplexitásának megértése lehet az egyik kulcs különböző betegségek sikeres kezeléséhez és biológiali kérdések megválaszolásához (Horvath, 2016, Nature Drug Disc., 15, 751). A rendszermikroszkópiában és rendszerbiológiában utóbbi időben végbement robbanásszerű fejlődés lehetővé teszi a képek automatikus és objektiv kiértékelését akár sok milliónyi kép és milliárd sejt esetében is (Badertscher, 2016, Cell Reports, 13, 12, 2879). Az egyik legnagyobb kihivást ezen a területen 3D kontraszanyag nélküli fénymikroszkópos képek egysejt szintű analizise jelenti. Jelen project célja egy olyan rendszer fejlesztése mely első lépésben ezen képek digitális korrekcióját végzi (Smith, 2015, Nature Methods, 12, 404), majd egy olyan rekonstrukciós lépést fejleszteni, mely visszaforditja a mikroszkóp képalkotó modelljét és egy szegmentálásra alkalmas képet állit elő. Ezen a rekonstruált képen egy mély neurális hálózat a sejtek fenotipizálását végzi majd. A csoportunk által fejlesztett sejtmanipulációs eljárás segitségével pedig végül a gépi intelligencia által választott sejtek kommunikációját mérjük.
előírt nyelvtudás: angol felvehető hallgatók száma: 1
Bejelentkezés
