Thesis supervisor: Csilla Laczka
Location of studies (in Hungarian): MTA TTK, Enzimológiai Tanszék Abbreviation of location of studies: MTA
Description of the research topic:
Az emberi genomban 11 Organikus Anion Transzporter Polipeptidet (OATP) kódoló gént (SLCO) azonosítottak. Az OATP család tagjai plazmamembránban megtalálható fehérjék, amelyek változatos kémiai szerkezetű, amfipatikus vagy negatívan töltött molekulákat ismernek fel és azok sejtekbe történő felvételét segítik elő. A humán OATP család több tagja esetében igazolták, hogy azok működése befolyásolja gyógyszermolekulák (pl. sztatinok, kemoterápiás és antivirális szerek) felszívódását illetve szervezetből való kiürülését. Emiatt ezek az OATP-k a farmakogenetikai kutatások egyik fontos célpontjai. Az OATP család tagjai farmakológiai jelentőségük mellett például az epesó homeosztázisban illetve egyes szervek hormonfelvételében is fontosak. Tehát polimorf változataik betegségek, patológiás állapotok (például gyulladásos bélbetegség, IBD: inflammatory bowel disease) kialakulásához vezethetnek. Az OATP-k fokozott termelődése megfigyelhető különféle rák-típusokban, szerepük a rákos folyamatokban azonban még nem tisztázott. Szintén nyitott kérdés még az OATP-k transzport mechanizmusának megválaszolása. Sőt, a család több tagjának pontos funkciója sem ismert még.
Az adatbázisokban szereplő adatok alapján 11 OATP génről alternatív splicing révén többféle izoforma keletkezhet. Ezeknek a fehérje változatoknak a valós expressziója, funkcióra esetleg lokalizációra kifejtett hatása azonban még nem tisztázott.
Célkitűzések:
Jelen kutatás keretében aminosav cserét okozó OATP SNP változatok és izoformák jellemzésével fogunk foglalkozni.
1. Az eddigi farmakogenetikai kutatások igazolták, hogy a máj specifikus OATP1B1 és 1B3 polimorf változatai eltérő gyógyszer farmakokinetikát eredményezhetnek. Kutatásunk során ezen változatok vizsgálatára alkalmas in vitro esszét állítunk be, amelynek segítségével adott genotípus és a gyógyszer-transzport hatékonysága közötti összefüggések tesztelhetők.
2. Az OATP2B1, OATP4A1 és OATP6A1 fehérjékben előforduló polimorfizmusokat összefüggésbe hozták gyulladásos bélbetegség kialakulásával. Terveink között szerepel ilyen betegséggel érintett csoporton az adott SNP-k allél-frekvenciáinak meghatározása és összevetése egészséges populáción kapott adatokkal, illetve a variánsok in vitro funkcionális jellemzése.
3. Szintén célul tűztük ki a rákos sejtekben megnövekedett expressziót mutató OATP6A1 és 4A1 fehérjék SNP-inek analízisét akut mieloid leukémiás illetve vastagbélrákos beteg-csoporton.
4. Végezetül egészséges szövetből illetve tumoros betegekből és sejtvonalakból származó RNS mintákon megvizsgáljuk az OATP izoformák jelenlétét. Reményeink szerint ezáltal azonosítani tudjuk a valósan megjelenő izoformákat, illetve azok esetleges, normál vagy tumor-specifikus megjelenését. Mindezek mellett a valósan megjelenő izoformákat heterológ expressziós rendszerek és in vitro esszé segítségével jellemezzük.
Number of students who can be accepted: 3
Deadline for application: 2024-06-30
2024. IV. 17. ODT ülés Az ODT következő ülésére 2024. június 14-én, pénteken 10.00 órakor kerül sor a Semmelweis Egyetem Szenátusi termében (Bp. Üllői út 26. I. emelet).
Login
